COVID-19 ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ವೈರಲ್ ರೂಪಾಂತರಗಳ ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಸ್ಥಳೀಕರಣ

ಕೋವಿಡ್-19 ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಾಗಿ ಹಲವಾರು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳು ಈಗಾಗಲೇ ಬಳಕೆಯಲ್ಲಿವೆ ಅಥವಾ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಹಂತದಲ್ಲಿವೆ.ತೀವ್ರವಾದ ತೀವ್ರವಾದ ಉಸಿರಾಟದ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ 2 (SARS-CoV-2) ನ ಹೊಸ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಹೊರಹೊಮ್ಮುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ, ಅವರು ಇನ್ನೂ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತಾರೆಯೇ ಎಂದು ಊಹಿಸಲು ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ.ಸ್ಟಾರ್ ಮತ್ತು ಇತರರು.ಯೀಸ್ಟ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು SARS-CoV-2 ರಿಸೆಪ್ಟರ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್‌ನಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಅದು ಹೋಸ್ಟ್ ರಿಸೆಪ್ಟರ್ (ACE2) ಗೆ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಬಲವಾಗಿ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಈ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮೂರು ಮುಖ್ಯ ವಿರೋಧಿ SARS-CoV ಮೇಲೆ ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಕ್ಷೆ ಮಾಡಿ. -2 ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆ.ಈ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು ರೆಜೆನೆರಾನ್ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಮಿಶ್ರಣದಲ್ಲಿ ಎರಡು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಏಕ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತವೆ.ಒಂದೇ ಪ್ರತಿಕಾಯದಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಅನೇಕ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಹರಡುತ್ತಿವೆ.
ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳು ತೀವ್ರವಾದ ಉಸಿರಾಟದ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ 2 (SARS-CoV-2) ಚಿಕಿತ್ಸೆಗೆ ಸಂಭಾವ್ಯ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ವೈರಸ್ ತಮ್ಮ ಅಪಾಯದಿಂದ ಪಾರಾಗಲು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ.ಇಲ್ಲಿ, SARS-CoV-2 ರಿಸೆಪ್ಟರ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ (RBD) ನಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ ರೂಪಾಂತರಗಳು REGN-COV2 ಕಾಕ್‌ಟೈಲ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತಿಕಾಯ LY-CoV016 ಗೆ ಬಂಧಿಸುವುದರ ಮೇಲೆ ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಾವು ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡುತ್ತೇವೆ.ಈ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆಗಳು REGN-COV2 ಮಿಶ್ರಣವನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ತಪ್ಪಿಸುವ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದವು, ಇದು ವಿಭಿನ್ನ ರಚನಾತ್ಮಕ ಎಪಿಟೋಪ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುವ ಎರಡು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಾದ REGN10933 ಮತ್ತು REGN10987 ರ ಸಂಯೋಜನೆಯಾಗಿದೆ.ಈ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು REGN-COV2 ಮತ್ತು ಇನ್ ವಿಟ್ರೊ ವೈರಸ್ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಆಯ್ಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ನಿರಂತರವಾಗಿ ಸೋಂಕಿತ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿದ ವೈರಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸಹ ಗುರುತಿಸುತ್ತವೆ.ಅಂತಿಮವಾಗಿ, ಈ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳು ಒಂದೇ ಪ್ರತಿಕಾಯದಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಈಗಾಗಲೇ SARS-CoV-2 ತಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಪರಿಚಲನೆಯಲ್ಲಿವೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ.ಈ ಸಂಪೂರ್ಣ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ನಕ್ಷೆಗಳು ವೈರಸ್ ಕಣ್ಗಾವಲು ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಬಹುದು.
ತೀವ್ರವಾದ ತೀವ್ರವಾದ ಉಸಿರಾಟದ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ 2 (SARS-CoV-2) (1) ಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ನೀಡಲು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ.ಕೆಲವು ಇತರ ವೈರಸ್‌ಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳು ಸೋಂಕಿತ ರೋಗಿಗಳ (2, 3) ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿದ ವೈರಸ್ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಂದ ನಿಷ್ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಬಹುದು ಅಥವಾ ಸಂಪೂರ್ಣ ವೈರಸ್ ಕ್ಲೇಡ್‌ಗೆ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ನೀಡಲು ಜಾಗತಿಕವಾಗಿ ಹರಡಿರುವ ವೈರಲ್ ರೂಪಾಂತರಗಳು.ಆದ್ದರಿಂದ, ಯಾವ SARS-CoV-2 ರೂಪಾಂತರಗಳು ಪ್ರಮುಖ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವುದು ವೈರಸ್ ಕಣ್ಗಾವಲು ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಪ್ರತಿಕಾಯ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿತ್ವವನ್ನು ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಣಯಿಸಲು ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿದೆ.
ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮುಖ SARS-CoV-2 ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳು ವೈರಲ್ ರಿಸೆಪ್ಟರ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ (RBD) ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಆಂಜಿಯೋಟೆನ್ಸಿನ್ ಪರಿವರ್ತಿಸುವ ಕಿಣ್ವ 2 (ACE2) ರಿಸೆಪ್ಟರ್ (5, 6) ಗೆ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, RBD ಯ ಎಲ್ಲಾ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಆಂಟಿವೈರಲ್ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ಅದರ ಕಾರ್ಯ ಮತ್ತು ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಕ್ಷೆ ಮಾಡಲು ನಾವು ಆಳವಾದ ರೂಪಾಂತರ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದೇವೆ (7, 8).ಈ ವಿಧಾನವು RBD ಮ್ಯಟೆಂಟ್‌ಗಳ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ರಚಿಸುವುದು, ಅವುಗಳನ್ನು ಯೀಸ್ಟ್‌ನ ಮೇಲ್ಮೈಯಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ರೂಪಾಂತರವು RBD ಮಡಿಸುವಿಕೆ, ACE2 ಸಂಬಂಧ (ಟೈಟರೇಶನ್ ಸರಣಿಯಲ್ಲಿ ಅಳೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ಪ್ರತಿದೀಪಕ-ಸಕ್ರಿಯ ಕೋಶ ವಿಂಗಡಣೆ ಮತ್ತು ಆಳವಾದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸುವುದನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. (ಚಿತ್ರ S1A).ಈ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, ನಾವು (7) ನಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಿರುವ ಪುನರಾವರ್ತಿತ ರೂಪಾಂತರಿತ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಬಳಸಿದ್ದೇವೆ, ಇದು ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಿದ RBD ರೂಪಾಂತರಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ, 3819 ಸಂಭವನೀಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ 3804 ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.ನಮ್ಮ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಆರಂಭಿಕ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾದ ವುಹಾನ್-ಹು-1 ರ RBD ಅನುವಂಶಿಕ ಹಿನ್ನೆಲೆಯಿಂದ ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ.ಹಲವಾರು ಮ್ಯಟೆಂಟ್‌ಗಳ ಆವರ್ತನವು ಹೆಚ್ಚುತ್ತಿದೆಯಾದರೂ, ಅವು ಇನ್ನೂ ಸಾಮಾನ್ಯ RBD ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತವೆ (9, 10).RBD ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಮತ್ತು ACE ಬೈಂಡಿಂಗ್ (7) ಅನ್ನು REGN-COV2 ಕಾಕ್‌ಟೈಲ್ (REGN10933 ಮತ್ತು REGN10987) (11, 12) ಮತ್ತು ಎಲಿ ಲಿಲ್ಲಿಯ LY-CoV016 ರ ಮರುಸಂಯೋಜಕ ರೂಪವನ್ನು ಹೇಗೆ ರವಾನಿಸುವುದು ಎಂಬುದನ್ನು ನಾವು 2034 ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಎರಡು ರಚಿಸಿದ್ದೇವೆ. ಪ್ರತಿಕಾಯವು ಪ್ರತಿಕಾಯವನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ವಿಧಾನದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ (ಇದನ್ನು CB6 ಅಥವಾ JS016 ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) (13) (ಚಿತ್ರ S1B).REGN-COV2 ಗೆ ಇತ್ತೀಚೆಗೆ COVID-19 (14) ಗಾಗಿ ತುರ್ತು ಬಳಕೆಯ ಅಧಿಕಾರವನ್ನು ನೀಡಲಾಯಿತು, ಆದರೆ LY-CoV016 ಪ್ರಸ್ತುತ ಹಂತ 3 ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಪ್ರಯೋಗಗಳಿಗೆ (15) ಒಳಗಾಗುತ್ತಿದೆ.
[Glu406→Trp(E406W)] ಎರಡು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳ ಮಿಶ್ರಣದಿಂದ ಬಲವಾಗಿ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಂಡಿದೆ (ಚಿತ್ರ 1A).LY-CoV016 ರ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಮ್ಯಾಪ್ RBD ಯಲ್ಲಿನ ವಿವಿಧ ಸೈಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಪಾರು ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದೆ (ಚಿತ್ರ 1B).ಯೀಸ್ಟ್-ಪ್ರದರ್ಶಿತ RBD ಬಳಸಿ ಆಳವಾದ ರೂಪಾಂತರ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್‌ನ ಹಿಂದಿನ ಅಳತೆಗಳ ಪ್ರಕಾರ, ಕೆಲವು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ACE2 ಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಅಥವಾ ಸೂಕ್ತವಾಗಿ ಮಡಿಸಿದ ರೂಪದಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸುವ RBD ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಬಹುದು, ಅನೇಕ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಈ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೇಲೆ ಕಡಿಮೆ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಬೀರುವುದಿಲ್ಲ. ) (ಚಿತ್ರ 1, A ಮತ್ತು B ACE2 ಸಂಬಂಧದ ನಷ್ಟವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಚಿತ್ರ S2 RBD ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿನ ಇಳಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.
(A) REGN-COV2 ನಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಕಾಯವನ್ನು ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವುದು.ಎಡಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಸಾಲಿನ ಗ್ರಾಫ್ RBD ಯಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿ ಸೈಟ್‌ನಲ್ಲಿ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ (ಪ್ರತಿ ಸೈಟ್‌ನಲ್ಲಿನ ಎಲ್ಲಾ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಮೊತ್ತ).ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಲೋಗೋ ಚಿತ್ರವು ಬಲವಾದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಸ್ಥಳವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ (ನೇರಳೆ ಅಂಡರ್‌ಲೈನ್).ಪ್ರತಿ ಅಕ್ಷರದ ಎತ್ತರವು ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ರೂಪಾಂತರದಿಂದ ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ರೂಪಾಂತರಕ್ಕೆ 1 ರ "ಎಸ್ಕೇಪ್ ಸ್ಕೋರ್" ಸಂಪೂರ್ಣ ಪಾರು ಮಾಡಲು ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ.ಪ್ರತಿ ಸಾಲಿಗೆ y-ಆಕ್ಸಿಸ್ ಸ್ಕೇಲ್ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ, E406W ಎಲ್ಲಾ REGN ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಇದು ಕಾಕ್‌ಟೇಲ್‌ಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳ ಇತರ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಸೈಟ್‌ಗಳಿಂದ ತುಂಬಿರುತ್ತದೆ.ಸ್ಕೇಲೆಬಲ್ ಆವೃತ್ತಿಗಾಗಿ, S2, A ಮತ್ತು B, ಮಡಿಸಿದ RBD ಯ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಮೇಲೆ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದರ ಮೂಲಕ ನಕ್ಷೆಯನ್ನು ಬಣ್ಣ ಮಾಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.S2, C ಮತ್ತು D ಅನ್ನು ACE2 ಸಂಬಂಧ ಮತ್ತು RBD ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಮೇಲೆ ಪ್ರಭಾವವನ್ನು ವಿತರಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ ವೈರಸ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಗಳನ್ನು ಪರಿಚಲನೆ ಮಾಡುವ ಎಲ್ಲಾ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ.(B) (A) ನಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ, LY-CoV016 ಅನ್ನು ಸೆಳೆಯಿರಿ.(C) ತಟಸ್ಥೀಕರಣದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲು ಸ್ಪೈಕ್-ಸೂಡೋಟೈಪ್ಡ್ ಲೆಂಟಿವೈರಲ್ ಕಣಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ.ಚಲಾವಣೆಯಲ್ಲಿರುವ SARS-CoV-2 ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಗಳಲ್ಲಿ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ N439K) ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಭಾವವನ್ನು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆವರ್ತನದಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲು ನಾವು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದ್ದೇವೆ.ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಬಿಂದುವು D614G ಹೊಂದಿರುವ ಅನ್‌ಮ್ಯುಟೇಟೆಡ್ ವೈಲ್ಡ್-ಟೈಪ್ (WT) ಯ ಉತ್ತುಂಗಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ರೂಪಾಂತರದ ಮಧ್ಯದ ಪ್ರತಿಬಂಧಕ ಸಾಂದ್ರತೆಯ (IC50) ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.ನೀಲಿ ಡ್ಯಾಶ್ ಮಾಡಿದ ಸಾಲು 1 WT ಯಂತೆಯೇ ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸುವ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮೌಲ್ಯ> 1 ಹೆಚ್ಚಿದ ತಟಸ್ಥೀಕರಣ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ.ನೀವು ನಕ್ಷೆಯಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಬಯಸುತ್ತೀರಾ ಎಂಬುದನ್ನು ಡಾಟ್‌ನ ಬಣ್ಣವು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.IC50 ಬಳಸಿದ ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವ ಸರಣಿಯ ಹೊರಗಿರುವುದರಿಂದ, ಬಹು ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲಾಗಿದೆ (ಮೇಲಿನ ಅಥವಾ ಕೆಳಗಿನ ಮಿತಿ) ಎಂದು ಚುಕ್ಕೆಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.ಹೆಚ್ಚಿನ ರೂಪಾಂತರಿತ ರೂಪಗಳನ್ನು ನಕಲಿನಲ್ಲಿ ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಎರಡು ಅಂಕಗಳಿವೆ.ಸಂಪೂರ್ಣ ನ್ಯೂಟ್ರಾಲೈಸೇಶನ್ ಕರ್ವ್ ಅನ್ನು ಚಿತ್ರ 2. S3 ರಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳ ಒಂದು ಅಕ್ಷರದ ಸಂಕ್ಷೇಪಣಗಳು ಈ ಕೆಳಗಿನಂತಿವೆ: A, Ala;ಸಿ, ಸಿಸ್ಟೀನ್;D, Asp;ಇ, ಗ್ಲು;F, Phe;ಜಿ, ಗ್ಲೈ;ಎಚ್, ಅವನ;I, Ile;ಕೆ, ಲೈಸಿನ್;ಎಲ್, ಲಿಯು;ಮೆಟ್ರೊಪೊಲಿಸ್ ಎನ್, ಅಸೆನ್;ಪಿ, ಪ್ರೊ;Q, Gln;ಆರ್, ಆರ್ಗ್;ಎಸ್, ಸೆರ್;T, Thr;ವಿ, ವಾಲ್;W, ಟ್ರಿಪ್ಟೊಫಾನ್;ಮತ್ತು ವೈ, ಟೈರ್.
ಪ್ರಮುಖ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಪ್ರತಿಜನಕ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ, ನಾವು ಪ್ಯಾನಿಕ್ಲ್ ಸ್ಯೂಡೋಟೈಪ್ಡ್ ಲೆಂಟಿವೈರಲ್ ಕಣಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸುವ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಮ್ಯಾಪ್ ಮತ್ತು ನ್ಯೂಟ್ರಲೈಸೇಶನ್ ಅಸ್ಸೇ (ಚಿತ್ರ 1C ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S3) ನಡುವೆ ಸ್ಥಿರತೆ ಇದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ.REGN-COV2 ಪ್ರತಿಕಾಯ ನಕ್ಷೆಯಿಂದ ನಿರೀಕ್ಷಿಸಿದಂತೆ, ಸ್ಥಾನ 486 ರಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು REGN10933 ನಿಂದ ಮಾತ್ರ ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ 439 ಮತ್ತು 444 ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು REGN10987 ನಿಂದ ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಈ ರೂಪಾಂತರಗಳು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.ಆದರೆ E406W ಎರಡು REGN-COV2 ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಂಡಿತು, ಆದ್ದರಿಂದ ಇದು ಮಿಶ್ರಣದಿಂದ ಬಲವಾಗಿ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಂಡಿದೆ.ರಚನಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ವೈರಸ್ ಪಾರು ಆಯ್ಕೆಯ ಮೂಲಕ, ಕಾಕ್‌ಟೈಲ್‌ನಲ್ಲಿರುವ ಎರಡು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ಯಾವುದೇ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ರೂಪಾಂತರವು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ ಎಂದು ರೆಜೆನೆರಾನ್ ನಂಬುತ್ತಾರೆ (11, 12), ಆದರೆ ನಮ್ಮ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆಯು E406W ಅನ್ನು ಕಾಕ್‌ಟೈಲ್ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರವೆಂದು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ.E406W REGN-COV2 ಪ್ರತಿಕಾಯವನ್ನು ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು RBD ಯ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಗಂಭೀರವಾಗಿ ಹಸ್ತಕ್ಷೇಪ ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ, ಏಕೆಂದರೆ ಇದು LY-CoV016 (ಚಿತ್ರ 1C) ನ ತಟಸ್ಥೀಕರಣ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಸ್ವಲ್ಪಮಟ್ಟಿಗೆ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮೊನಚಾದ ಹುಸಿ ಮಾದರಿಯ ಲೆಂಟಿವೈರಲ್ ಕಣಗಳ ಶೀರ್ಷಿಕೆ ( ಚಿತ್ರ S3F).
ನಮ್ಮ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಮ್ಯಾಪ್ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಆಯ್ಕೆಯ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ವೈರಸ್‌ಗಳ ವಿಕಸನದೊಂದಿಗೆ ಸ್ಥಿರವಾಗಿದೆಯೇ ಎಂದು ಅನ್ವೇಷಿಸಲು, ನಾವು ಮೊದಲು ರೆಜೆನೆರಾನ್ ವೈರಸ್ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಆಯ್ಕೆ ಪ್ರಯೋಗದ ಡೇಟಾವನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಿದ್ದೇವೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ REGN10933 ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಸ್ಪೈಕ್ ಅನ್ನು ಬೆಳೆಸಲಾಯಿತು. ಸ್ಟೊಮಾಟಿಟಿಸ್ ವೈರಸ್ (VSV), REGN10987 ಅಥವಾ REGN-COV2 ಕಾಕ್ಟೈಲ್ (12).ಈ ಕೆಲಸವು REGN10933 ನಿಂದ ಐದು ಪಾರು ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದೆ, REGN10987 ನಿಂದ ಎರಡು ಪಾರು ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮತ್ತು ಕಾಕ್ಟೈಲ್‌ನಿಂದ ಯಾವುದೇ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಲ್ಲ (ಚಿತ್ರ 2A).ಎಲ್ಲಾ ಏಳು ಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಗಳಿಂದ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿದ ರೂಪಾಂತರಗಳು ನಮ್ಮ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಮ್ಯಾಪ್‌ನಲ್ಲಿ ಹೈಲೈಟ್ ಆಗಿವೆ ಮತ್ತು ವುಹಾನ್-ಹು-1 RBD ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ವೈಲ್ಡ್-ಟೈಪ್ ಕೋಡಾನ್‌ನ ಏಕ-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಸಹ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು (ಚಿತ್ರ 2B), ಎಸ್ಕೇಪ್ಸ್ ಕಾನ್ಕಾರ್ಡನ್ಸ್ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಜೀವಕೋಶದ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಕಾಯದ ಒತ್ತಡದಲ್ಲಿ ಗ್ರಾಫ್ ಮತ್ತು ವೈರಸ್ ವಿಕಸನ.ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಂದ E406W ಅನ್ನು ಪ್ರವೇಶಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ಗಮನಿಸಬೇಕಾದ ಅಂಶವಾಗಿದೆ, ಇದು RBD ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಮತ್ತು ACE2 ಬಾಂಧವ್ಯದ ಉತ್ತಮ ಸಹಿಷ್ಣುತೆಯ ಹೊರತಾಗಿಯೂ ರಿಜೆನೆರಾನ್ ಕಾಕ್ಟೈಲ್ ಆಯ್ಕೆಯು ಅದನ್ನು ಏಕೆ ಗುರುತಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.
(A) ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ, ಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ವೈರಸ್ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲು ರೆಜೆನೆರಾನ್ ಪ್ಯಾನಿಕ್ಲ್ ಸೂಡೊಟೈಪ್ VSV ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ (12).(B) ಚಿತ್ರ 1A ನಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಿರುವಂತೆ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೇಖಾಚಿತ್ರ, ಆದರೆ ವುಹಾನ್-ಹು-1 ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬದಲಾವಣೆಯಿಂದ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.ಬೂದು ಅಲ್ಲದ ಬಣ್ಣವು ಜೀವಕೋಶದ ಸಂಸ್ಕೃತಿ (ಕೆಂಪು), ಮತ್ತು ಸೋಂಕಿತ ರೋಗಿಗಳು (ನೀಲಿ) ಅಥವಾ ಎರಡರಲ್ಲೂ (ನೇರಳೆ) ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.ಚಿತ್ರ S5 ಈ ಗ್ರಾಫ್‌ಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, ರೂಪಾಂತರಗಳು ACE2 ಸಂಬಂಧ ಅಥವಾ RBD ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಮೇಲೆ ಹೇಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದರ ಮೂಲಕ ಬಣ್ಣಿಸಲಾಗಿದೆ.(C) ಸೋಂಕಿನ 145 ನೇ ದಿನದಂದು REGN-COV2 ನೊಂದಿಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ಪಡೆದ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ RBD ರೂಪಾಂತರದ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರ (ಕಪ್ಪು ಚುಕ್ಕೆಗಳ ಲಂಬ ರೇಖೆ).E484A ಮತ್ತು F486I ನಡುವಿನ ಸಂಪರ್ಕದ ಆವರ್ತನವು ಹೆಚ್ಚಾಯಿತು, ಆದರೆ E484A ನಮ್ಮ ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರವಲ್ಲದ ಕಾರಣ, ಅದನ್ನು ಇತರ ಪ್ಯಾನೆಲ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ.ಚಿತ್ರವನ್ನೂ ನೋಡಿ.S4.(D) ಜೀವಕೋಶದ ಸಂಸ್ಕೃತಿ ಮತ್ತು ಸೋಂಕಿತ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುವ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್‌ನಿಂದ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು, ಮತ್ತು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯು ACE2 ಸಂಬಂಧಕ್ಕೆ ಯಾವುದೇ ಪ್ರಮುಖ ವೆಚ್ಚವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ [ಯೀಸ್ಟ್ ಪ್ರದರ್ಶನ ವಿಧಾನದಿಂದ ಅಳೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ (7)].ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಬಿಂದುವು ರೂಪಾಂತರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಆಕಾರ ಮತ್ತು ಬಣ್ಣವು ವೈರಸ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅದನ್ನು ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದೇ ಮತ್ತು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಬಹುದೇ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.x-ಅಕ್ಷದ ಮೇಲೆ ಹೆಚ್ಚು ಬಲಗೈ ಬಿಂದುಗಳು ಪ್ರಬಲವಾದ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬಂಧಿಸುವ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ;y-ಅಕ್ಷದ ಮೇಲಿನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಬಿಂದುಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ACE2 ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.
ಎಸ್ಕೇಪ್ ಅಟ್ಲಾಸ್ ಮಾನವರಿಗೆ ಸೋಂಕು ತಗುಲಿಸುವ ವೈರಸ್‌ಗಳ ವಿಕಾಸವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಬಹುದೇ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಲು, COVID-19 ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ನಂತರ 145 ನೇ ದಿನದಂದು REGN-COV2 ಅನ್ನು ಪಡೆದ ನಿರಂತರ ಸೋಂಕಿತ ರೋಗನಿರೋಧಕ ರೋಗಿಯಿಂದ ಆಳವಾದ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾವನ್ನು ನಾವು ಪರಿಶೀಲಿಸಿದ್ದೇವೆ (16).ತಡವಾದ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯು ರೋಗಿಯ ವೈರಲ್ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯು ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ಒತ್ತಡದಿಂದ ನಡೆಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ರೋಗಿಯು ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ಮೊದಲು ದುರ್ಬಲವಾದ ಸ್ವಯಂ ನ್ಯೂಟ್ರಲೈಸಿಂಗ್ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾನೆ (16).REGN-COV2 ಆಡಳಿತದ ನಂತರ, RBD ಯಲ್ಲಿನ ಐದು ಅಮೈನೋ ಆಸಿಡ್ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಆವರ್ತನವು ವೇಗವಾಗಿ ಬದಲಾಗಿದೆ (ಚಿತ್ರ 2C ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S4).ನಮ್ಮ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ನಕ್ಷೆಯು ಈ ಮೂರು ರೂಪಾಂತರಗಳು REGN10933 ಮತ್ತು ಒಂದು REGN10987 (ಚಿತ್ರ 2B) ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಂಡಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ.ಪ್ರತಿಕಾಯದ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ನಂತರ, ಎಲ್ಲಾ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಸ್ಥಿರ ಸೈಟ್ಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ ಎಂದು ಗಮನಿಸಬೇಕಾದ ಅಂಶವಾಗಿದೆ.ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಸ್ಪರ್ಧೆಯ ಏರಿಕೆ ಮತ್ತು ಕುಸಿತವಿದೆ (ಚಿತ್ರ 2C).ಈ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಇತರ ವೈರಸ್‌ಗಳ (17, 18) ಅಡಾಪ್ಟಿವ್ ಹೋಸ್ಟ್‌ಗಳ ಆಂತರಿಕ ವಿಕಾಸದಲ್ಲಿ ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ, ಪ್ರಾಯಶಃ ಆನುವಂಶಿಕ ಮುಕ್ತ-ಸವಾರಿ ಮತ್ತು ವೈರಲ್ ವಂಶಾವಳಿಗಳ ನಡುವಿನ ಸ್ಪರ್ಧೆಯಿಂದಾಗಿ.ನಿರಂತರ ಸೋಂಕಿನ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ಈ ಎರಡೂ ಶಕ್ತಿಗಳು ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತವೆ (ಚಿತ್ರ 2C ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S4C): E484A (ನಮ್ಮ ರೇಖಾಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರವಲ್ಲ) ಮತ್ತು F486I (ಎಸ್ಕೇಪ್ REGN10933) ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ನಂತರ ಉಚಿತ ಸವಾರಿ, ಮತ್ತು N440D ಮತ್ತು ವೈರಸ್ ವಂಶಾವಳಿಗಳನ್ನು ಹೊತ್ತೊಯ್ಯುತ್ತದೆ Q493K (ಕ್ರಮವಾಗಿ REGN10987 ಮತ್ತು REGN10933 ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದು) ಮೊದಲು REGN10933 ಎಸ್ಕೇಪ್ ಮ್ಯುಟೆಂಟ್ Y489H ನೊಂದಿಗೆ ಸ್ಪರ್ಧಿಸಿತು, ಮತ್ತು ನಂತರ E484A ಮತ್ತು F486I ಮತ್ತು Q493K ಸಾಗಿಸುವ ವಂಶಾವಳಿಯೊಂದಿಗೆ ಸ್ಪರ್ಧಿಸಿತು.
REGN-COV2 ನೊಂದಿಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ಪಡೆದ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿನ ನಾಲ್ಕು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲಿ ಮೂರನ್ನು ರೆಜೆನೆರಾನ್‌ನ ವೈರಸ್ ಸೆಲ್ ಕಲ್ಚರ್ ಆಯ್ಕೆಯಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ (ಚಿತ್ರ 2B), ಇದು ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆಯ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ.ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯ ಪ್ರಯೋಗದಲ್ಲಿ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಲಾದ ಯಾವುದೇ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಅವರು ಗುರುತಿಸಬಲ್ಲ ಕಾರಣ ವೈರಸ್ ಆಯ್ಕೆಯು ಅಪೂರ್ಣವಾಗಿದೆ.ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆಯು ಎಲ್ಲಾ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಟಿಪ್ಪಣಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಚಿಕಿತ್ಸೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸದ ಕಾರಣಗಳಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು, ಆದರೆ ಆಕಸ್ಮಿಕವಾಗಿ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ.
ಸಹಜವಾಗಿ, ವೈರಸ್‌ಗಳ ವಿಕಸನವು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಮಿತಿಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳನ್ನು ತಪ್ಪಿಸುವ ಒತ್ತಡದಿಂದ ಪ್ರಭಾವಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ.ಜೀವಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಆಯ್ಕೆಯಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮತ್ತು ರೋಗಿಗಳು ಯಾವಾಗಲೂ ಕೆಳಗಿನ ಮಾನದಂಡಗಳನ್ನು ಪೂರೈಸುತ್ತಾರೆ: ಅವು ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಒಂದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬದಲಾವಣೆಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ACE2 ಸಂಬಂಧಕ್ಕೆ ಕಡಿಮೆ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ವೆಚ್ಚವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ [ಈಸ್ಟ್ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಮಾಪನ RBD (7) ಬಳಸಿ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲಾದ ಹಿಂದಿನ ಆಳವಾದ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಮೂಲಕ. )] (ಚಿತ್ರ 2D ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S5).ಆದ್ದರಿಂದ, ರೂಪಾಂತರಗಳು ಹೇಗೆ RBD ಯ ಪ್ರಮುಖ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಫಿನೋಟೈಪ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದರ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ACE ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕಾಯ ಬೈಂಡಿಂಗ್) ವೈರಸ್ ವಿಕಸನಕ್ಕೆ ಸಂಭವನೀಯ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ನಿರ್ಣಯಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು.ಒಂದು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯೆಂದರೆ, ದೀರ್ಘವಾದ ವಿಕಸನೀಯ ಸಮಯದ ಚೌಕಟ್ಟಿನಲ್ಲಿ, ವೈರಲ್ ರೋಗನಿರೋಧಕ ಶಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಡ್ರಗ್ ಎಸ್ಕೇಪ್‌ನಲ್ಲಿ ಗಮನಿಸಿದಂತೆ, ಎಪಿಸ್ಟಾಟಿಕ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದಾಗಿ, ರೂಪಾಂತರಗಳಿಗೆ ಸಹಿಷ್ಣುತೆಯ ಸ್ಥಳವು ಬದಲಾಗಬಹುದು (19-21).
ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆಯು ಪರಿಚಲನೆಯಲ್ಲಿರುವ SARS-CoV-2 ನಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡಲು ನಮಗೆ ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.ನಾವು ಜನವರಿ 11, 2021 ರಂತೆ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಮಾನವ-ಪಡೆದ SARS-CoV-2 ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಿದ್ದೇವೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ RBD ರೂಪಾಂತರಗಳು ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ಪಾರಾಗಿರುವುದನ್ನು ಕಂಡುಕೊಂಡಿದ್ದೇವೆ (ಚಿತ್ರ 3).ಆದಾಗ್ಯೂ, >0.1% ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಇರುವ ಏಕೈಕ ಎಸ್ಕೇಪ್ ರೂಪಾಂತರವೆಂದರೆ REGN10933 ಎಸ್ಕೇಪ್ ಮ್ಯುಟೆಂಟ್ Y453F [0.3% ಅನುಕ್ರಮ;ನೋಡಿ (12)], REGN10987 ಎಸ್ಕೇಪ್ ರೂಪಾಂತರಿತ N439K [1.7% ಅನುಕ್ರಮ;ಚಿತ್ರ 1C ಮತ್ತು (22)], ಮತ್ತು LY-CoV016 ಎಸ್ಕೇಪ್ ಮ್ಯುಟೇಶನ್ K417N (0.1% ಅನುಕ್ರಮ; ಚಿತ್ರ 1C ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ).Y453F ನೆದರ್ಲ್ಯಾಂಡ್ಸ್ ಮತ್ತು ಡೆನ್ಮಾರ್ಕ್ (23, 24) ನಲ್ಲಿ ಮಿಂಕ್ ಫಾರ್ಮ್‌ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಸ್ವತಂತ್ರ ಏಕಾಏಕಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ;ಮಿಂಕ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ F486L (24) ನಂತಹ ಇತರ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಗಮನಿಸಬೇಕಾದ ಅಂಶವಾಗಿದೆ.N439K ಯುರೋಪ್‌ನಲ್ಲಿ ಬಹಳ ಜನಪ್ರಿಯವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಯುರೋಪ್‌ನಲ್ಲಿ ಸ್ಕಾಟ್‌ಲ್ಯಾಂಡ್ ಮತ್ತು ಐರ್ಲೆಂಡ್‌ನ ಅನುಕ್ರಮದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಭಾಗವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ (22, 25).K417N ದಕ್ಷಿಣ ಆಫ್ರಿಕಾದಲ್ಲಿ ಮೊದಲು ಪತ್ತೆಯಾದ B.1.351 ವಂಶಾವಳಿಯಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ (10).ಪ್ರಸ್ತುತ ಕಾಳಜಿಯ ಮತ್ತೊಂದು ರೂಪಾಂತರವು N501Y ಆಗಿದೆ, ಇದು B.1.351 ನಲ್ಲಿದೆ ಮತ್ತು UK (9) ನಲ್ಲಿ ಮೂಲತಃ ಗುರುತಿಸಲಾದ B.1.1.7 ವಂಶಾವಳಿಯಲ್ಲಿಯೂ ಇದೆ.REGN-COV2 ಪ್ರತಿಕಾಯದ ಮೇಲೆ N501Y ಯಾವುದೇ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ನಮ್ಮ ನಕ್ಷೆಯು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ LY-CoV016 (ಚಿತ್ರ 3) ಮೇಲೆ ಮಾತ್ರ ಮಧ್ಯಮ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ.
ಪ್ರತಿ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಸಂಯೋಜನೆಗೆ, ಜನವರಿ 11, 2021 ರಂತೆ, GISAID (26) ನಲ್ಲಿನ 317,866 ಉನ್ನತ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಮಾನವ-ಪಡೆದ SARS-CoV-2 ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ, ಪ್ರತಿ ರೂಪಾಂತರದ ಎಸ್ಕೇಪ್ ಸ್ಕೋರ್ ಮತ್ತು ಅದರ ಆವರ್ತನದ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧ .ಇದನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ.REGN-COV2 ಕಾಕ್‌ಟೈಲ್ ಎಸ್ಕೇಪ್ ರೂಪಾಂತರ E406W ಗೆ ವುಹಾನ್-ಹು-1 RBD ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಬಹು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಅಗತ್ಯವಿದೆ ಮತ್ತು GISAID ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಗಮನಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ.ಶೇಷ E406 (E406Q ಮತ್ತು E406D) ಯ ಇತರ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಆವರ್ತನ ಎಣಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಗಮನಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಈ ರೂಪಾಂತರಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು W ನಿಂದ ದೂರದಲ್ಲಿರುವ ಏಕೈಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ರೂಪಾಂತರಗಳಲ್ಲ.
ನಿರೀಕ್ಷೆಯಂತೆ, ಪ್ರತಿಕಾಯ-RBD ಇಂಟರ್‌ಫೇಸ್‌ನಲ್ಲಿ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ.ಆದಾಗ್ಯೂ, ಯಾವ ರೂಪಾಂತರಗಳು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಕೇವಲ ರಚನೆಯು ಸಾಕಾಗುವುದಿಲ್ಲ.ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ACE2 ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ವಿಶಾಲವಾದ ಎಪಿಟೋಪ್‌ಗೆ ಬಂಧಿಸಲು LY-CoV016 ಅದರ ಭಾರವಾದ ಮತ್ತು ಹಗುರವಾದ ಸರಪಳಿಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಹೆವಿ ಚೈನ್ ಕಾಂಪ್ಲಿಮೆಂಟರಿಟಿ ನಿರ್ಧರಿಸುವ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ RBD ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ (ಚಿತ್ರ 4A ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S6, E ಗೆ ಜಿ).ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, REGN10933 ಮತ್ತು REGN10987 ನಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಹೆವಿ ಮತ್ತು ಲೈಟ್ ಚೈನ್‌ಗಳ ಇಂಟರ್‌ಫೇಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಜೋಡಿಸಲಾದ RBD ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸಿದೆ (ಚಿತ್ರ 4A ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S6, A ನಿಂದ D).REGN-COV2 ಮಿಶ್ರಣದಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಂಡ E406W ರೂಪಾಂತರವು ಪ್ರತಿಕಾಯದೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕ ಹೊಂದಿರದ ಉಳಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸಿದೆ (ಚಿತ್ರ 4, A ಮತ್ತು B).E406 ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ LY-CoV016 (ಚಿತ್ರ 4B ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S6H) ಗೆ ಹತ್ತಿರವಾಗಿದ್ದರೂ, E406W ರೂಪಾಂತರವು ಪ್ರತಿಕಾಯದ ಮೇಲೆ ಕಡಿಮೆ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಬೀರುತ್ತದೆ (ಚಿತ್ರ 1, B ಮತ್ತು C), ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ದೀರ್ಘ-ಶ್ರೇಣಿಯ ರಚನಾತ್ಮಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು REGN ವಿರೋಧಿಯಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. - COV2 ಪ್ರತಿಕಾಯ (ಚಿತ್ರ S6I).ಸಾರಾಂಶದಲ್ಲಿ, ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕದಲ್ಲಿರುವ RBD ಅವಶೇಷಗಳಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಯಾವಾಗಲೂ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆ ವಹಿಸುವುದಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕವಿಲ್ಲದ ಉಳಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಗಮನಾರ್ಹವಾದ ಪಾರು ರೂಪಾಂತರಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ (ಚಿತ್ರ 4B ಮತ್ತು ಚಿತ್ರ S6, D ಮತ್ತು G ).
(A) ಪ್ರತಿಕಾಯದಿಂದ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ RBD ರಚನೆಯ ಮೇಲೆ ಪ್ರಕ್ಷೇಪಿಸಲಾದ ಎಸ್ಕೇಪ್ ರೇಖಾಚಿತ್ರ.[REGN10933 ಮತ್ತು REGN10987: ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (PDB) ID 6XDG (11);LY-CoV016: PDB ID 7C01 (13)].ಪ್ರತಿಕಾಯದ ಭಾರವಾದ ಮತ್ತು ಹಗುರವಾದ ಸರಪಳಿಗಳ ವೇರಿಯಬಲ್ ಡೊಮೇನ್‌ಗಳನ್ನು ನೀಲಿ ಕಾರ್ಟೂನ್‌ಗಳಾಗಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು RBD ಯ ಮೇಲ್ಮೈಯಲ್ಲಿನ ಬಣ್ಣವು ಈ ಸೈಟ್‌ನಲ್ಲಿ ರೂಪಾಂತರ-ಮಧ್ಯಸ್ಥ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯ ಬಲವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ (ಬಿಳಿಯು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಕೆಂಪು ಪ್ರಬಲವಾದುದನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಅಥವಾ ಮಿಶ್ರಣದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ತಾಣ) .ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಗೊಳ್ಳದ ಸೈಟ್‌ಗಳು ಬೂದು ಬಣ್ಣವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ.(B) ಪ್ರತಿ ಪ್ರತಿಕಾಯಕ್ಕೆ, ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ನೇರ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಸಂಪರ್ಕ (ಪ್ರತಿಕಾಯದ 4Å ಒಳಗೆ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಅಲ್ಲದ ಪರಮಾಣುಗಳು), ಪ್ರಾಕ್ಸಿಮಲ್ ಪ್ರತಿಕಾಯ (4 ರಿಂದ 8Å) ಅಥವಾ ದೂರದ ಪ್ರತಿಕಾಯ (> 8Å) ಎಂದು ವರ್ಗೀಕರಿಸಿ.ಪ್ರತಿ ಪಾಯಿಂಟ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಎಸ್ಕೇಪ್ (ಕೆಂಪು) ಅಥವಾ ನಾನ್-ಸ್ಕೇಪ್ (ಕಪ್ಪು) ಎಂದು ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ.ಗ್ರೇ ಡ್ಯಾಶ್ ಮಾಡಿದ ರೇಖೆಯು ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಎಸ್ಕೇಪ್ ಅಥವಾ ನಾನ್-ಸ್ಕೇಪ್ ಎಂದು ವರ್ಗೀಕರಿಸಲು ಬಳಸುವ ನಿರ್ಣಾಯಕ ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ (ವಿವರಗಳಿಗಾಗಿ, ಮೆಟೀರಿಯಲ್ಸ್ ಮತ್ತು ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ನೋಡಿ).ಕೆಂಪು ಮತ್ತು ಕಪ್ಪು ಸಂಖ್ಯೆಗಳು ಪ್ರತಿ ವರ್ಗದಲ್ಲಿ ಎಷ್ಟು ಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಈ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, ಮೂರು ಪ್ರಮುಖ SARS-CoV-2 ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳನ್ನು ತಪ್ಪಿಸುವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ನಾವು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಿದ್ದೇವೆ.ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಹಿಂದಿನ ಗುಣಲಕ್ಷಣವು ಅಪೂರ್ಣವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಈ ನಕ್ಷೆಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ.REGN-COV2 ಕಾಕ್‌ಟೈಲ್‌ನಲ್ಲಿನ ಎರಡು ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಏಕೈಕ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ ಅಥವಾ ಕಾಕ್ಟೈಲ್‌ನೊಂದಿಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ಪಡೆದ ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿರಂತರ ಸೋಂಕಿನ ರೋಗಿಗಳನ್ನು ಅವರು ಗುರುತಿಸಿಲ್ಲ.ರೂಪಾಂತರ.ಸಹಜವಾಗಿ, ನಮ್ಮ ನಕ್ಷೆಯು ಇನ್ನೂ ಹೆಚ್ಚು ಒತ್ತುವ ಪ್ರಶ್ನೆಗೆ ಉತ್ತರಿಸಿಲ್ಲ: SARS-CoV-2 ಈ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳಿಗೆ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಪ್ರತಿರೋಧವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸುತ್ತದೆಯೇ?ಆದರೆ ಖಚಿತವಾದ ಸಂಗತಿಯೆಂದರೆ, ಹಲವು ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ರೂಪಾಂತರಗಳು RBD ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಅಥವಾ ರಿಸೆಪ್ಟರ್ ಬಾಂಧವ್ಯದ ಮೇಲೆ ಕಡಿಮೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ವೈರಸ್‌ಗಳನ್ನು ಪರಿಚಲನೆ ಮಾಡುವಲ್ಲಿ ಈಗಾಗಲೇ ಕೆಲವು ಕಡಿಮೆ-ಮಟ್ಟದ ರೂಪಾಂತರಗಳಿವೆ.ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ, SARS-CoV-2 ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ನಡುವೆ ಹರಡಿದಾಗ ಯಾವ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ರವಾನಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಿ ಮತ್ತು ಗಮನಿಸುವುದು ಅವಶ್ಯಕ.ವೈರಲ್ ಜೀನೋಮ್ ಕಣ್ಗಾವಲು ವರ್ಗೀಕರಿಸಿದ ರೂಪಾಂತರಗಳ ಪ್ರಭಾವವನ್ನು ತಕ್ಷಣವೇ ವಿವರಿಸುವ ಮೂಲಕ ನಮ್ಮ ಕೆಲಸವು "ವೀಕ್ಷಣೆ" ಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
ಇದು ಕ್ರಿಯೇಟಿವ್ ಕಾಮನ್ಸ್ ಅಟ್ರಿಬ್ಯೂಷನ್ ಪರವಾನಗಿಯ ನಿಯಮಗಳ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ವಿತರಿಸಲಾದ ಮುಕ್ತ ಪ್ರವೇಶ ಲೇಖನವಾಗಿದೆ.ಲೇಖನವು ಮೂಲ ಕೃತಿಯನ್ನು ಸರಿಯಾಗಿ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಿರುವ ಷರತ್ತಿನ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಅನಿಯಂತ್ರಿತ ಬಳಕೆ, ವಿತರಣೆ ಮತ್ತು ಪುನರುತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.
ಗಮನಿಸಿ: ನಿಮ್ಮ ಇಮೇಲ್ ವಿಳಾಸವನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಮಾತ್ರ ನಾವು ನಿಮ್ಮನ್ನು ಕೇಳುತ್ತೇವೆ ಇದರಿಂದ ನೀವು ಪುಟಕ್ಕೆ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗೆ ನೀವು ಇಮೇಲ್ ಅನ್ನು ನೋಡಲು ಬಯಸುತ್ತೀರಿ ಮತ್ತು ಅದು ಸ್ಪ್ಯಾಮ್ ಅಲ್ಲ ಎಂದು ತಿಳಿಯುತ್ತದೆ.ನಾವು ಯಾವುದೇ ಇಮೇಲ್ ವಿಳಾಸಗಳನ್ನು ಸೆರೆಹಿಡಿಯುವುದಿಲ್ಲ.
ನೀವು ಸಂದರ್ಶಕರೇ ಎಂಬುದನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಮತ್ತು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಸ್ಪ್ಯಾಮ್ ಸಲ್ಲಿಕೆಯನ್ನು ತಡೆಯಲು ಈ ಪ್ರಶ್ನೆಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಟೈಲರ್ ಎನ್.ಸ್ಟಾರ್, ಆಲಿಸನ್ ಜೆ.ಗ್ರೀನಿ, ಅಮೀನ್ ಅಡೆಟಿಯಾ, ವಿಲಿಯಂ ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಹ್ಯಾನನ್, ಮನೀಶ್ ಸಿ. ಚೌಧರಿ (ಮನೀಷ್ ಸಿ. ಚೌಧರಿ), ಆಡಮ್ ಎಸ್. ಡಿಂಗಸ್ (ಆಡಮ್ ಎಸ್.
ರೆಜೆನೆರಾನ್ ಮೊನೊಕ್ಲೋನಲ್ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಮಿಶ್ರಣದಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ SARS-CoV-2 ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆಯು ರೋಗಿಗಳಿಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ನೀಡುವಲ್ಲಿ ವೈರಸ್‌ನ ವಿಕಾಸವನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
ಟೈಲರ್ ಎನ್.ಸ್ಟಾರ್, ಆಲಿಸನ್ ಜೆ.ಗ್ರೀನಿ, ಅಮೀನ್ ಅಡೆಟಿಯಾ, ವಿಲಿಯಂ ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಹ್ಯಾನನ್, ಮನೀಶ್ ಸಿ. ಚೌಧರಿ (ಮನೀಷ್ ಸಿ. ಚೌಧರಿ), ಆಡಮ್ ಎಸ್. ಡಿಂಗಸ್ (ಆಡಮ್ ಎಸ್.
ರೆಜೆನೆರಾನ್ ಮೊನೊಕ್ಲೋನಲ್ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಮಿಶ್ರಣದಿಂದ ತಪ್ಪಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ SARS-CoV-2 ರೂಪಾಂತರಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ನಕ್ಷೆಯು ರೋಗಿಗಳಿಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆ ನೀಡುವಲ್ಲಿ ವೈರಸ್‌ನ ವಿಕಾಸವನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
©2021 ಅಮೇರಿಕನ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ​​ಫಾರ್ ದಿ ಅಡ್ವಾನ್ಸ್‌ಮೆಂಟ್ ಆಫ್ ಸೈನ್ಸ್.ಎಲ್ಲ ಹಕ್ಕುಗಳನ್ನು ಕಾಯ್ದಿರಿಸಲಾಗಿದೆ.AAAS HINARI, AGORA, OARE, CHORUS, CLOCKSS, CrossRef ಮತ್ತು COUNTER ನ ಪಾಲುದಾರ. ಸೈನ್ಸ್ ISSN 1095-9203.