Якчанд антителоҳо ҳамчун табобат барои табобати COVID-19 аллакай истифода мешаванд ё дар ҳоли таҳия мебошанд.Бо пайдоиши вариантҳои нави синдроми шадиди роҳи нафасии коронавирус 2 (SARS-CoV-2), пешгӯӣ кардан муҳим аст, ки оё онҳо то ҳол ба табобати антитело ҳассос хоҳанд буд.Старр ва дигарон.Китобхонаи хамиртуруш истифода шуд, ки ҳама мутатсияҳоро дар домени ҳатмии ретсепторҳои SARS-CoV-2 фаро мегирад, ки пайвастшавиро бо ретсептори ҳост (ACE2) сахт халалдор намекунад ва харита кунед, ки чӣ гуна ин мутацияҳо ба се асосии зидди SARS-CoV таъсир мерасонанд. -2 пайвастани антитело.Ин рақамҳо мутацияҳоеро муайян мекунанд, ки аз пайвасти антитело гурезанд, аз ҷумла мутатсияҳои ягонае, ки аз ду антитело дар омехтаи антителоҳои Regeneron гурезанд.Бисёр мутатсияҳое, ки аз як антитело гурезанд, дар одамон паҳн мешаванд.
Антителоҳо як табобати эҳтимолӣ барои табобати синдроми шадиди роҳи нафасии коронавирус 2 (SARS-CoV-2) мебошанд, аммо маълум нест, ки вирус барои гурехтан аз хатари онҳо инкишоф меёбад.Дар ин ҷо мо харита медиҳем, ки чӣ гуна ҳама мутатсияҳо дар домени ҳатмии ретсепторҳои SARS-CoV-2 (RBD) ба пайвастшавии коктейл REGN-COV2 ба антитело LY-CoV016 таъсир мерасонанд.Ин харитаҳои мукаммал мутацияи аминокислотаро ошкор карданд, ки омехтаи REGN-COV2-ро комилан канорагирӣ кард, ки аз ду антитело REGN10933 ва REGN10987 иборат аст, ки эпитопҳои гуногуни сохториро ҳадаф қарор медиҳанд.Ин рақамҳо инчунин мутацияҳои вирусро муайян мекунанд, ки дар беморони мубталои сироятшуда бо REGN-COV2 ва ҳангоми интихоби фирор аз вирус дар vitro интихоб шудаанд.Дар ниҳоят, ин рақамҳо нишон медиҳанд, ки мутатсияҳое, ки аз як антитело гурезанд, аллакай дар штаммҳои гардиши SARS-CoV-2 мавҷуданд.Ин харитаҳои мукаммали фирор метавонанд оқибатҳои мутатсияҳои ҳангоми назорати вирусро шарҳ диҳанд.
Антиденоҳо барои табобати синдроми шадиди роҳи нафасии коронавирус 2 (SARS-CoV-2) таҳия карда мешаванд (1).Антителоҳо бар зидди баъзе вирусҳои дигар метавонанд тавассути мутацияҳои вирусӣ, ки ҳангоми табобати беморони сироятшуда интихоб шудаанд (2, 3) ё мутацияҳои вирусӣ, ки дар саросари ҷаҳон паҳн шудаанд, то муқовимат ба тамоми вирусро таъмин кунанд.Аз ин рӯ, муайян кардани он, ки кадом мутатсияҳои SARS-CoV-2 аз антителоҳои калидӣ раҳо ёфта метавонанд, барои муайян кардани он, ки чӣ гуна мутатсияҳое, ки ҳангоми назорати вирус мушоҳида мешаванд, ба самаранокии терапияи антитело таъсир мерасонанд, муҳим аст.
Аксарияти антителоҳои пешбари зидди SARS-CoV-2 домени ҳатмии ретсепторҳои вирусиро (RBD) ҳадаф қарор медиҳанд, ки миёнаравӣ ба ресепторҳои ангиотензин табдилдиҳандаи ферменти 2 (ACE2) мебошад (5, 6).Ба наздикӣ, мо як усули сканкунии амиқи мутатсияро таҳия кардем, то нишон диҳад, ки чӣ гуна ҳама мутатсияҳои RBD ба функсия ва эътирофи он аз ҷониби антителоҳои антивирусӣ таъсир мерасонанд (7, 8).Ин усул ташкили китобхонаи мутантҳои RBD, ифодаи онҳо дар рӯи хамиртуруш ва истифодаи ҷудокунии ҳуҷайраҳои бо флуоресцентӣ фаъолшуда ва пайдарпайии амиқ барои муайян кардани миқдори он, ки ҳар як мутация ба қабати RBD, наздикии ACE2 (дар силсилаи титратсия чен карда шудааст) ва ҳатмии антитело таъсир мерасонад, дар бар мегирад. (Расми S1A).Дар ин тадқиқот, мо китобхонаи мутантҳои такроршавандаи дар (7) тавсифшударо истифода бурдем, ки аз вариантҳои штрих-кодшудаи RBD иборат аст, ки 3804 аз мутатсияҳои имконпазири 3819 аминокислотаро фаро мегирад.Китобхонаи мо аз заминаи генетикии RBD аз изолятсияи аввали Вуҳан-Ху-1 омода карда шудааст.Гарчанде ки басомади якчанд мутантҳо зиёд шуда истодааст, онҳо то ҳол пайдарпаии маъмултарини RBD-ро намояндагӣ мекунанд (9, 10).Мо ду мутацияи 2034-ро кашидаем, ки ба қабати RBD ва пайвасти ACE сахт халал намерасонанд (7) чӣ гуна бояд коктейлҳои REGN-COV2 (REGN10933 ва REGN10987) (11, 12) ва Эли Лилли аз LY-CoV016 Шакли рекомбинантии антитело ба усули пайваст кардани антитело таъсир мерасонад (инчунин CB6 ё JS016 номида мешавад) (13) (Расми S1B).Ба наздикӣ REGN-COV2 иҷозати истифодаи фавқулодда барои COVID-19 дода шуд (14), дар ҳоле ки LY-CoV016 айни замон аз озмоишҳои клиникии марҳилаи 3 мегузарад (15).
[Glu406→Trp(E406W)] аз омехтаи ду антитело сахт гурехт (Расми 1А).Харитаи фирор аз LY-CoV016 инчунин мутатсияҳои зиёди фирорро дар сайтҳои гуногуни RBD ошкор кардааст (Расми 1B).Гарчанде ки баъзе мутатсияҳои фирорӣ метавонанд қобилияти RBD-ро барои пайвастшавӣ ба ACE2 ё дар шакли дуруст печонидашуда коҳиш диҳанд, мувофиқи ченакҳои қаблии сканкунии амиқи мутатсия бо истифодаи RBD-и хамиртуруш, бисёр мутатсияҳои функсионалӣ ба ин хосиятҳои функсионалӣ таъсири кам ё тамоман надоранд (7) ) (Расми 1, A ва B талафоти наздикии ACE2-ро ифода мекунад, дар ҳоле ки Расми S2 коҳиши ифодаи RBD-ро ифода мекунад.
(A) Харитаи антитело дар REGN-COV2.Графикаи хати чап фирорро дар ҳар як макони RBD нишон медиҳад (маҷмӯи ҳамаи мутатсияҳо дар ҳар як сайт).Тасвири логотип дар тарафи рост ҷойгиршавии қавии фирорро нишон медиҳад (хати арғувон).Баландии ҳар як ҳарф ба қувваи фирор, ки тавассути мутатсияи аминокислотаҳо миёнаравӣ мешавад, мутаносиб аст ва "холҳои фирор" -и 1 барои ҳар як мутация ба фирор пурра мувофиқат мекунад.Миқёси меҳвари y барои ҳар як сатр гуногун аст, аз ин рӯ, масалан, E406W аз ҳама антителоҳои REGN гурезад, аммо ин барои коктейлҳо равшантар аст, зеро он аз ҷониби дигар маконҳои фирор аз антителоҳои инфиродӣ пур шудааст.Барои версияи миқёспазир, S2, A ва B барои ранг кардани харита аз рӯи он, ки мутацияҳо ба ифодаи RBD-и қатшуда чӣ гуна таъсир мерасонанд, истифода мешаванд.S2, C ва D барои тақсим кардани таъсир ба наздикии ACE2 ва ифодаи RBD дар байни ҳама мутатсияҳое, ки дар изолятҳои гардиши вирус мушоҳида мешаванд, истифода мешаванд.(B) Тавре ки дар (A) нишон дода шудааст, LY-CoV016-ро кашед.(C) Барои санҷидани мутатсияҳои калидӣ дар таҳлили безараргардонӣ зарраҳои лентивирусии псевдотипи хӯшаҳоро истифода баред.Мо тафтиши мутатсияҳоеро интихоб кардем, ки дар изолятсияҳои SARS-CoV-2 (масалан N439K) дар гардиш таъсири бештар доранд ё дар басомади баланд вуҷуд доранд.Ҳар як нуқта афзоиши якбораи консентратсияи ингибитори медианӣ (IC50)-и мутатсияро нисбат ба қуллаи навъи ваҳшӣ (WT) -и дорои D614G ифода мекунад.Хати хати кабуди 1 таъсири безараргардонии шабеҳи WT ва арзиши> 1 муқовимати афзояндаи безараргардониро ифода мекунад.Ранги нуқта нишон медиҳад, ки оё шумо мехоҳед аз харита гурезед.Нуқтаҳо нишон медиҳанд, ки азбаски IC50 берун аз силсилаи ҳалкунии истифодашуда аст, тағироти сершумор тафтиш карда мешавад (маҳдудияти болоӣ ё поёнӣ).Аксар мутантҳо дар ду нусха санҷида мешаванд, аз ин рӯ ду нукта вуҷуд дорад.Хатти пурраи безараргардонӣ дар расми 2. S3 нишон дода шудааст.Ихтисороти якҳафи боқимондаҳои аминокислотаҳо инҳоянд: A, Ala;C, систеин;Д, Асп;Е, Глу;Ф, Фе;Г, Гли;Ҳ, ӯ;I, Ile;К, лизин;Л, Лю;Метрополис Н, Ассен;P, Pro;Q, Gln;Р, Арг;С, Сер;T, Thr;В, Вал;В, триптофан;ва Ю, Тир.
Барои санҷидани таъсири антигении мутатсияҳои калидӣ, мо таҳлили безараргардониро бо истифода аз зарраҳои псевдотипии лентивирусии паникул анҷом додем ва дарёфтем, ки байни харитаи фирор барои антитело ва таҳлили безараргардонӣ мувофиқат мавҷуд аст (Расми 1C ва Расми S3).Тавре ки аз харитаи антителоҳои REGN-COV2 интизор мерафт, мутатсия дар мавқеи 486 танҳо аз ҷониби REGN10933 безарар карда мешавад, дар ҳоле ки мутация дар мавқеъҳои 439 ва 444 танҳо аз ҷониби REGN10987 безарар карда мешавад, аз ин рӯ ин мутатсияҳо гурехта наметавонанд.Аммо E406W аз ду антитело REGN-COV2 гурехт, аз ин рӯ он инчунин аз омехта сахт гурехт.Тавассути таҳлили сохторӣ ва интихоби гурези вирус, Regeneron боварӣ дорад, ки ягон мутатсияи ягонаи аминокислотаҳо аз ду антитело дар коктейл гурехта наметавонад (11, 12), аммо харитаи пурраи мо E406W-ро ҳамчун мутацияи гурези коктейл муайян мекунад.E406W ба антиденои REGN-COV2 ба таври нисбатан мушаххас таъсир мерасонад ва ба функсияи RBD ба таври ҷиддӣ халал намерасонад, зеро он танҳо каме таъсири безараргардонии LY-CoV016 (Расми 1C) ва титри зарраҳои псевдотипии лентивирусиро каме коҳиш медиҳад (Расми). S3F).
Барои фаҳмидани он, ки оё харитаи гурези мо бо эволютсияи вирусҳо дар зери интихоби антитело мувофиқат мекунад, мо аввал маълумоти озмоиши интихоби гурези вируси Regeneron-ро тафтиш кардем, ки дар он хӯшаи ифода дар фарҳанги ҳуҷайра дар ҳузури ҳама гуна REGN10933 весикулярӣ парвариш карда шудааст. вируси стоматит (VSV), REGN10987 ё коктейл REGN-COV2 (12).Ин кор панҷ мутатсияи фирор аз REGN10933, ду мутацияи фирор аз REGN10987 ва ягон мутатсия аз коктейлро муайян накардааст (Расми 2А).Мутацияҳое, ки аз ҷониби ҳамаи ҳафт фарҳангҳои ҳуҷайра интихоб шудаанд, дар харитаи фирории мо қайд карда шудаанд ва тағирёбии як нуклеотиди кодони навъи ваҳшӣ дар пайдарпаии Wuhan-Hu-1 RBD низ дастрас аст (Расми 2B), ки фарқияти байни фирорҳои Concordance-ро нишон медиҳад. график ва эволютсияи вирус дар зери фишори антитело дар фарҳанги ҳуҷайра.Қобили зикр аст, ки E406W-ро тавассути тағирёбии як нуклеотид дастрас кардан мумкин нест, ки ин метавонад фаҳмонад, ки чаро интихоби коктейлҳои Regeneron сарфи назар аз таҳаммулпазирии нисбатан хуби қабати RBD ва наздикии ACE2 онро муайян карда наметавонад.
(A) Дар ҳузури антителоҳо, Regeneron псевдотипи паникулаи VSV-ро барои интихоби мутатсияҳои гурези вирус дар фарҳанги ҳуҷайра истифода мебарад (12).(B) Диаграммаи фирор, тавре ки дар расми 1А нишон дода шудааст, аммо танҳо мутатсияҳоро нишон медиҳад, ки тавассути тағирёбии як нуклеотид дар пайдарпаии Вуҳан-Ху-1 дастрас аст.Хокистарранг мутацияро дар фарҳанги ҳуҷайра (сурх) ва беморони сироятшуда (кабуд) ё ҳарду (арғувон) нишон медиҳад.Дар расми S5 ин графикҳо нишон дода шудаанд, ки аз рӯи он ки мутацияҳо ба наздикии ACE2 ё ифодаи RBD таъсир мерасонанд, ранг карда шудаанд.(C) Кинетикаи мутатсияи RBD дар беморони муолиҷаи REGN-COV2 дар рӯзи 145-уми сироят (хатти амудии сиёҳ нуқта).Басомади робита байни E484A ва F486I зиёд шуд, аммо азбаски E484A дар расми мо мутацияи фирор нест, он дар панелҳои дигар нишон дода нашудааст.Ҳамчунин нигаред ба расм.S4.(D) Мутацияҳои фирорӣ, ки дар фарҳанги ҳуҷайра ва беморони сироятшуда ба вуҷуд меоянд, тавассути як нуклеотид дастрасанд ва пайвастани антителоҳои фирорӣ барои наздикии ACE2 хароҷоти калон намерасонад [тавре ки бо усули намоиши хамиртуруш чен карда шудааст (7)].Ҳар як нуқта мутатсия аст ва шакл ва ранги он нишон медиҳад, ки оё онро ҳангоми афзоиши вирус дастрас кардан ва интихоб кардан мумкин аст.Нуқтаҳои бештари дасти рост дар меҳвари x нишон медиҳанд, ки қавитар аз антитело фирор мекунад;нуқтаҳои баландтар дар меҳвари Y нишон медиҳанд, ки наздикии ACE2 баландтар аст.
Барои муайян кардани он, ки оё Escape Atlas метавонад эволютсияи вирусҳои сирояткунандаи одамонро таҳлил кунад, мо маълумоти пайдарпайии амиқро аз як бемори доимии мубталои иммунитет, ки REGN-COV2-ро дар рӯзи 145-уми пас аз ташхиси табобати COVID-19 гирифтааст, тафтиш кардем (16).Табобати дер ба популяцияи вирусии бемор имкон медиҳад, ки гуногунии генетикиро ҷамъ оварад, ки баъзеи онҳо метавонанд аз фишори масуният ба вуҷуд оянд, зеро бемор пеш аз табобат аксуламали заифи антителоҳои автономӣ дорад (16).Пас аз ворид кардани REGN-COV2, басомади панҷ мутатсияи аминокислотаҳо дар RBD зуд тағйир ёфт (Тасвири 2C ва Расми S4).Харитаи гурези мо нишон дод, ки се аз ин мутация аз REGN10933 ва яке аз REGN10987 гурехтааст (Расми 2B).Бояд қайд кард, ки пас аз муолиҷаи антитело на ҳама мутатсияҳо ба макони муқарраршуда интиқол дода шуданд.Баръакс, афзоиши ва пастшавии рақобат вуҷуд дорад (Расми 2С).Ин намуна дар эволютсияи дохилии ҳостҳои мутобиқшавандаи вирусҳои дигар мушоҳида шудааст (17, 18), эҳтимолан аз сабаби рақобати байни генетикии озод саворӣ ва наслҳои вирусӣ.Чунин ба назар мерасад, ки ҳардуи ин қувваҳо дар беморони гирифтори сирояти доимӣ нақш мебозанд (Расми 2C ва расми S4C): E484A (мутацияи фирор дар диаграммаи мо нест) ва F486I (фирори REGN10933) пас аз табобат ва наслҳои вируси N440D ва Q493K (гурехтани REGN10987 ва REGN10933) аввал бо мутанти фирор аз REGN10933 Y489H рақобат кард ва сипас бо насли E484A ва F486I ва Q493K рақобат кард.
Се аз чаҳор мутацияи фирорӣ дар беморони бо REGN-COV2 табобатшуда дар интихоби фарҳанги ҳуҷайраҳои вируси Регенерон муайян карда нашудаанд (Расми 2B), ки бартарии харитаи мукаммалро нишон медиҳад.Интихоби вирус нопурра аст, зеро онҳо танҳо метавонанд ҳама гуна мутатсияҳои ба таври тасодуфӣ интихобшуда дар ин озмоиши фарҳанги ҳуҷайраро муайян кунанд.Баръакс, харитаи мукаммал ҳама мутатсияҳоро шарҳ медиҳад, ки метавонанд мутатсияҳоеро дар бар гиранд, ки бо сабабҳои ба табобат алоқаманд нестанд, аммо тасодуфан ба ҳатмии антитело таъсир мерасонанд.
Албатта, ба эволютсияи вирусҳо маҳдудиятҳои функсионалӣ ва фишор барои гурехтани антителоҳо таъсир мерасонад.Мутацияҳо ва бемороне, ки дар фарҳанги ҳуҷайра интихоб шудаанд, ҳамеша ба меъёрҳои зерин мувофиқат мекунанд: онҳо аз пайвастани антитело гурезанд, метавонанд тавассути як тағирёбии нуклеотид ворид шаванд ва ба наздикии ACE2 арзиши кам ё тамоман надоранд [тавассути мутатсияҳои амиқи қаблӣ, ки бо истифода аз ченкунии хамиртуруши Scanning RBD нишон дода шудаанд (7) )] (Расми 2D ва Расми S5).Аз ин рӯ, харитаи пурраи он, ки чӣ гуна мутатсияҳо ба фенотипҳои асосии биохимиявии RBD таъсир мерасонанд (ба монанди ACE ва пайвасти антитело) метавонад барои арзёбии роҳҳои имконпазири эволютсияи вирус истифода шавад.Як огоҳӣ ин аст, ки дар чаҳорчӯбаи вақти эволютсионии тӯлонӣ, тавре ки дар иммунитети вирусӣ ва гурези маводи мухаддир мушоҳида мешавад, аз сабаби таъсири мутақобилаи эпистатикӣ, фазои таҳаммулпазирӣ ба мутатсияҳо метавонад тағир ёбад (19-21).
Харитаи мукаммал ба мо имкон медиҳад, ки мутацияҳои мавҷудаи фирор дар гардиши SARS-CoV-2-ро арзёбӣ кунем.Мо ҳама пайдарпаии дастраси SARS-CoV-2-ро аз 11 январи соли 2021 тафтиш кардем ва дарёфтем, ки шумораи зиёди мутатсияҳои RBD аз як ё якчанд антитело гурехтаанд (Расми 3).Аммо, ягона мутацияи фирорӣ, ки дар >0,1% пайдарпай мавҷуд аст, REGN10933 мутанти фирорӣ Y453F [0,3% пайдарпаӣ;нигаред (12)], REGN10987 фирор мутант N439K [1,7% пайдарпаии;нигаред ба расми 1C ва (22)], Ва мутацияи LY-CoV016 фирор аз K417N (пайванди 0,1%; инчунин ба расми 1С нигаред).Y453F бо хуруҷи мустақили марбут ба хоҷагиҳои норка дар Нидерландия ва Дания алоқаманд аст (23, 24);Бояд қайд кард, ки худи пайдарпаии норка баъзан мутатсияҳои дигари фирорро дар бар мегирад, ба монанди F486L (24).N439K дар Аврупо хеле маъмул аст ва қисми зиёди пайдарпаии Шотландия ва Ирландия дар Аврупоро ташкил медиҳад (22, 25).K417N дар насли B.1.351 мавҷуд аст, ки бори аввал дар Африқои Ҷанубӣ кашф шудааст (10).Мутацияи дигари мавриди нигаронии кунунӣ N501Y мебошад, ки дар B.1.351 ва инчунин дар хати B.1.1.7, ки дар Британияи Кабир муайян шудааст, мавҷуд аст (9).Харитаи мо нишон медиҳад, ки N501Y ба антиденои REGN-COV2 таъсире надорад, аммо танҳо ба LY-CoV016 таъсири мӯътадил дорад (Расми 3).
Барои ҳар як антитело ё комбинатсияи антитело, то 11 январи соли 2021, дар байни 317,866 пайдарпаии баландсифати SARS-CoV-2 аз ҷониби инсон дар GISAID (26), муносибати байни холҳои фирор барои ҳар як мутатсия ва басомади он.Нишон дода шудааст.Мутацияи фирори коктейлҳои REGN-COV2 E406W тағироти сершумори нуклеотидҳоро дар пайдарпаии Вуҳан-Ху-1 RBD талаб мекунад ва дар пайдарпаии GISAID мушоҳида намешавад.Дигар мутатсияҳои боқимондаи E406 (E406Q ва E406D) бо ҳисобкунии басомади паст мушоҳида карда шуданд, аммо ин аминокислотаҳои мутант мутатсияҳои ягонаи нуклеотидҳо аз В.
Тавре интизор мерафт, мутатсияҳои фирорӣ одатан дар интерфейси антитело-RBD рух медиҳанд.Бо вуҷуди ин, танҳо сохтор барои пешгӯии кадом мутация миёнаравии гурехтан кофӣ нест.Масалан, LY-CoV016 занҷирҳои вазнин ва сабуки худро барои пайваст шудан ба эпитопи васеъ истифода мебарад, ки сатҳи ҳатмии ACE2-ро ба ҳам мепайвандад, аммо раванди фирор мутация дар боқимондаҳои RBD дар минтақаи муайянкунандаи иловагии занҷири вазнинро дар бар мегирад (Тасвири 4A ва Расми S6, E ба Г).Баръакси ин, фирор аз REGN10933 ва REGN10987 асосан дар пасмондаҳои RBD, ки дар интерфейси занҷирҳои вазнин ва сабуки антитело ҷойгир шудаанд (Тасвири 4А ва Расми S6, A то D).Мутацияи E406W, ки аз омехтаи REGN-COV2 раҳо ёфт, дар пасмондаҳое рух дод, ки бо ягон антитело дар тамос набуданд (Расми 4, А ва В).Гарчанде ки E406 аз ҷиҳати сохторӣ ба LY-CoV016 наздиктар аст (Расми 4B ва Расми S6H), мутатсияи E406W ба антитело таъсири хеле камтар дорад (Расми 1, B ва C), ки ин нишон медиҳад, ки механизми сохтории мушаххаси дарозмуддат зидди REGN аст. - Антитело COV2 (Расми S6I).Хулоса, мутатсияҳо дар боқимондаҳои RBD дар тамос бо антителоҳо на ҳамеша миёнаравӣ мекунанд ва баъзе мутатсияҳои муҳими фирор дар боқимондаҳое, ки бо антитело тамос надоранд (Тасвири 4B ва Расми S6, D ва G).
(A) Диаграммаи фирор дар сохтори RBD, ки бо антитело баста шудааст, пешбинӣ шудааст.[REGN10933 ва REGN10987: Махзани протеинҳо (PDB) ID 6XDG (11);LY-CoV016: PDB ID 7C01 (13)].Доменҳои тағирёбандаи занҷирҳои вазнин ва сабуки антитело ҳамчун карикатураҳои кабуд нишон дода шудаанд ва ранг дар рӯи RBD қувваи фирор аз мутация дар ин сайтро нишон медиҳад (сафед гурез нест ва сурх қавитаринро нишон медиҳад. макони фирор аз антитело ё омехта).Сайтҳое, ки аз ҷиҳати функсионалӣ мутатсия нашудаанд, хокистарранг мешаванд.(B) Барои ҳар як антитело маконро ҳамчун тамоси мустақими антитело (атомҳои ғайриҳидроген дар ҳудуди 4Å антитело), антителоҳои проксималӣ (4 то 8Å) ё антителоҳои дисталӣ (> 8Å) тасниф кунед.Ҳар як нуқта маконеро ифода мекунад, ки ба фирор (сурх) ё гурехтан (сиёҳ) тақсим мешавад.Хати рахнашудаи хокистарӣ арзиши муҳимеро, ки барои тасниф кардани сайт ҳамчун фирор ё гурез нест, ифода мекунад (барои тафсилот, ба мавод ва усулҳо нигаред).Рақамҳои сурх ва сиёҳ нишон медиҳанд, ки чӣ қадар сайтҳо дар ҳар як категория фирор карда шудаанд ё халос.
Дар ин таҳқиқот, мо мутатсияҳоеро, ки аз се антиденои асосии зидди SARS-CoV-2 канорагирӣ мекунанд, комилан харита кардем.Ин харитаҳо нишон медиҳанд, ки тавсифи қаблии мутатсияҳои фирорӣ нопурра аст.Мутатсияҳои ягонаи аминокислотаҳо, ки метавонанд аз ду антитело дар коктейл REGN-COV2 гурезанд, муайян карда нашудаанд ва онҳо аксарияти беморони сирояти доимиро, ки бо коктейл табобат карда шудаанд, муайян накардаанд.мутация.Албатта, харитаи мо то ҳол ба саволи муҳимтарин посух надодааст: Оё SARS-CoV-2 ба ин антителоҳо муқовимати васеъ пайдо мекунад?Аммо он чизе, ки мутмаин аст, нигаронкунанда аст, ки ин қадар мутатсияҳои фирорӣ ба қабати RBD ё наздикии ретсепторҳо таъсири кам доранд ва аллакай дар вирусҳои гардишгар баъзе мутатсияҳои сатҳи паст мавҷуданд.Дар ниҳоят, интизор шудан ва мушоҳида кардан лозим аст, ки SARS-CoV-2 ҳангоми паҳн шудани он дар байни аҳолӣ кадом мутацияҳоро интиқол медиҳад.Кори мо ба "мушоҳида" тавассути фавран шарҳ додани таъсири мутатсияҳое, ки аз ҷониби назорати геномҳои вирусӣ тасниф шудаанд, кӯмак хоҳад кард.
Ин мақолаи дастрасии кушода аст, ки тибқи шартҳои Литсензияи Creative Commons Attribution паҳн шудааст.Мақола имкон медиҳад, ки бидуни маҳдудият истифода, паҳн ва дубора тавлид дар ҳама гуна васоити ахбори омма бо шарти дуруст зикр кардани асари аслӣ.
Эзоҳ: Мо танҳо аз шумо хоҳиш мекунем, ки суроғаи почтаи электронии худро пешниҳод кунед, то шахсе, ки шумо ба саҳифа тавсия медиҳед, бидонад, ки шумо мехоҳед паёми электрониро бубинед ва он спам нест.Мо ягон суроғаи почтаи электрониро забт намекунем.
Ин савол барои санҷидани он, ки оё шумо меҳмон ҳастед ва пешгирии ирсоли спамҳои худкор истифода мешавад.
Тайлер Н.Старр, Эллисон Ҷ.Грини, Амин Аддетия, Вилям В. Ҳаннон, Маниш Ч.Чудхари (Маниш С. Чоудхари), Адам С. Дингес (Адам С.
Харитаи мукаммали мутатсияҳои SARS-CoV-2, ки аз омехтаи антителоҳои моноклоналии Regeneron гурехтааст, ба шарҳ додани эволютсияи вирус дар табобати беморон кӯмак мекунад.
Тайлер Н.Старр, Эллисон Ҷ.Грини, Амин Аддетия, Вилям В. Ҳаннон, Маниш Ч.Чудхари (Маниш С. Чоудхари), Адам С. Дингес (Адам С.
Харитаи мукаммали мутатсияҳои SARS-CoV-2, ки аз омехтаи антителоҳои моноклоналии Regeneron гурехтааст, ба шарҳ додани эволютсияи вирус дар табобати беморон кӯмак мекунад.
© 2021 Ассотсиатсияи Амрико оид ба пешрафти илм.ҳамаи ҳуқуқ маҳфуз аст.AAAS шарики HINARI, AGORA, OARE, CHORUS, CLOCKSS, CrossRef ва COUNTER.Science ISSN 1095-9203 мебошад.
Вақти фиристодан: 24 феврали 2021