topimg

Isọtẹlẹ agbegbe ti awọn iyipada gbogun ti o salọ fun awọn apo-ara ti a lo lati tọju COVID-19

Orisirisi awọn apo-ara ti wa ni lilo tabi labẹ idagbasoke bi awọn itọju ailera fun itọju COVID-19.Pẹlu ifarahan ti awọn iyatọ tuntun ti aarun atẹgun nla ti coronavirus 2 (SARS-CoV-2), o ṣe pataki lati ṣe asọtẹlẹ boya wọn yoo tun ni ifaragba si itọju ailera.Starr et al.Ile-ikawe iwukara kan ni a lo, eyiti o ni wiwa gbogbo awọn iyipada ninu agbegbe abuda olugba olugba SARS-CoV-2 ti kii yoo ṣe idiwọ isọdọkan si olugba agbalejo (ACE2), ati maapu bii awọn iyipada wọnyi ṣe ni ipa lori mẹta akọkọ anti-SARS-CoV -2 agboguntaisan abuda.Awọn eeka wọnyi ṣe idanimọ awọn iyipada ti o salọ isọdọmọ antibody, pẹlu awọn iyipada ẹyọkan ti o salọ fun awọn apo-ara meji ninu apopọ antibody Regeneron.Ọpọlọpọ awọn iyipada ti o salọ fun egboogi-ara kan ti n tan kaakiri ninu eniyan.
Awọn ọlọjẹ jẹ itọju ailera ti o pọju fun itọju ti aarun atẹgun nla ti coronavirus 2 (SARS-CoV-2), ṣugbọn ko han gbangba pe ọlọjẹ naa ndagba lati sa fun eewu wọn.Nibi, a ṣe maapu bii gbogbo awọn iyipada ninu agbegbe abuda olugba olugba SARS-CoV-2 (RBD) ṣe ni ipa lori isopọmọ ti amulumala REGN-COV2 si agboguntaisan LY-CoV016.Awọn maapu pipe wọnyi ṣe afihan iyipada amino acid kan ti o yago fun idapọ REGN-COV2 patapata, eyiti o jẹ ti awọn ọlọjẹ meji REGN10933 ati REGN10987 ti o fojusi oriṣiriṣi awọn epitopes igbekalẹ.Awọn isiro wọnyi tun ṣe idanimọ awọn iyipada ọlọjẹ ti a yan ni awọn alaisan ti o ni akoran ti o ni itara pẹlu REGN-COV2 ati lakoko yiyan ona abayo ọlọjẹ in vitro.Lakotan, awọn isiro wọnyi ṣafihan pe awọn iyipada ti o salọ fun ọlọjẹ kan ti wa tẹlẹ ni kaakiri awọn igara SARS-CoV-2.Awọn maapu abayo pipe wọnyi le ṣe alaye awọn abajade ti awọn iyipada ti a ṣe akiyesi lakoko iṣọwo ọlọjẹ.
Awọn ọlọjẹ ti wa ni idagbasoke lati ṣe itọju arun aarun atẹgun nla nla 2 (SARS-CoV-2) (1).Awọn aporo-ara lodi si awọn ọlọjẹ miiran le jẹ alailagbara nipasẹ awọn iyipada ọlọjẹ ti a yan lakoko itọju awọn alaisan ti o ni akoran (2, 3) tabi awọn iyipada gbogun ti o ti tan kaakiri agbaye lati funni ni atako si gbogbo bibo ọlọjẹ naa.Nitorinaa, ipinnu iru awọn iyipada SARS-CoV-2 le sa fun awọn apo-ara bọtini jẹ pataki lati ṣe iṣiro bii awọn iyipada ti a ṣe akiyesi lakoko iṣọ ọlọjẹ ṣe ni ipa imunadoko ti itọju ailera.
Pupọ julọ awọn ọlọjẹ anti-SARS-CoV-2 ti dojukọ agbegbe abuda olugba olugba gbogun (RBD), eyiti o ṣe agbedemeji isọdọmọ si olugba henensiamu iyipada angiotensin 2 (ACE2) (5, 6).Laipẹ, a ti ṣe agbekalẹ ọna ọlọjẹ iyipada jinjin lati ṣe maapu bii gbogbo awọn iyipada ti RBD ṣe ni ipa lori iṣẹ rẹ ati idanimọ nipasẹ awọn ọlọjẹ ọlọjẹ (7, 8).Ọna naa pẹlu ṣiṣẹda ile-ikawe kan ti awọn mutanti RBD, sisọ wọn lori dada iwukara, ati lilo yiyan sẹẹli ti a mu ṣiṣẹ fluorescence ati ilana ti o jinlẹ lati ṣe iwọn bi iyipada kọọkan ṣe ni ipa lori kika RBD, ACE2 affinity (ti a ṣe iwọn ni jara titration), ati abuda antibody. (Aworan S1A).Ninu iwadi yii, a lo ile-ikawe mutant ti atunwi ti a sapejuwe ninu (7), eyiti o jẹ pẹlu awọn iyatọ RBD barcoded, ti o bo 3804 ti 3819 ti o ṣee ṣe awọn iyipada amino acid.Ile-ikawe wa ti pese sile lati ipilẹ jiini RBD ti Wuhan-Hu-1 ti o ya sọtọ ni kutukutu.Botilẹjẹpe igbohunsafẹfẹ ti ọpọlọpọ awọn mutanti n pọ si, wọn tun ṣe aṣoju awọn ilana RBD ti o wọpọ julọ (9, 10).A ti ya meji ninu awọn iyipada 2034 ti ko ni idiwọ ipadanu kika RBD ati ACE abuda (7) bii o ṣe le kọja amulumala REGN-COV2 (REGN10933 ati REGN10987) (11, 12) ati Eli Lilly's LY-CoV016 Fọọmu atunṣe ti agboguntaisan yoo ni ipa lori ọna ti abuda antibody (tun npe ni CB6 tabi JS016) (13) (Figure S1B).REGN-COV2 laipẹ funni ni aṣẹ lilo pajawiri fun COVID-19 (14), lakoko ti LY-CoV016 n gba lọwọlọwọ awọn idanwo ile-iwosan alakoso 3 (15).
[Glu406→Trp(E406W)] sa fun ni agbara lati dapọ awọn ọlọjẹ meji (Aworan 1A).Maapu ona abayo ti LY-CoV016 tun ṣafihan ọpọlọpọ awọn iyipada ona abayo ni awọn aaye oriṣiriṣi ni RBD (Eya 1B).Botilẹjẹpe diẹ ninu awọn iyipada ona abayo le bajẹ agbara RBD lati sopọ mọ ACE2 tabi ṣafihan ni ọna ti o ṣe pọ ni deede, ni ibamu si awọn wiwọn iṣaaju ti ọlọjẹ iyipada jinlẹ nipa lilo RBD iwukara-ifihan, ọpọlọpọ awọn iyipada iṣẹ ni diẹ tabi ko si ipa lori awọn ohun-ini iṣẹ wọnyi (7). ) (Aworan 1, A ati B jẹ aṣoju isonu ti ibaramu ACE2, lakoko ti Nọmba S2 duro fun idinku ninu ikosile RBD.
(A) Ṣiṣe aworan apakokoro ni REGN-COV2.Aworan ila ti o wa ni apa osi fihan ona abayo ni aaye kọọkan ni RBD (apapọ gbogbo awọn iyipada ni aaye kọọkan).Aworan aami ti o wa ni apa ọtun fihan ipo ona abayo ti o lagbara (laini eleyi ti).Giga ti lẹta kọọkan jẹ iwọn si agbara ti ona abayo ti o ni ilaja nipasẹ iyipada amino acid, ati “Dimegililọ abayo” ti 1 fun iyipada kọọkan ni ibamu si ona abayo pipe.Iwọn y-axis yatọ fun laini kọọkan, nitorinaa, fun apẹẹrẹ, E406W yọ kuro ninu gbogbo awọn ọlọjẹ REGN, ṣugbọn o han gbangba julọ fun awọn cocktails nitori pe o bori nipasẹ awọn aaye abayo miiran ti awọn ọlọjẹ kọọkan.Fun ẹya ti o ni iwọn, S2, A ati B, ni a lo lati ṣe awọ maapu naa nipasẹ bii awọn iyipada ṣe ni ipa lori ikosile ti RBD ti ṣe pọ.S2, C ati D ni a lo lati pin kaakiri ipa lori isunmọ ACE2 ati ikosile RBD laarin gbogbo awọn iyipada ti a ṣe akiyesi ni awọn ipinya kaakiri ọlọjẹ.(B) Bi o ṣe han ninu (A), fa LY-CoV016.(C) Lo awọn patikulu lentiviral spike-pseudotyped lati mọ daju awọn iyipada bọtini ni idanwo didoju.A yan lati jẹrisi awọn iyipada ti o jẹ asọtẹlẹ lati ni ipa nla tabi wa ni ipo igbohunsafẹfẹ giga ni awọn ipinya SARS-CoV-2 (bii N439K) ninu kaakiri.Ojuami kọọkan duro fun ilosoke agbo ti ifọkansi inhibitory agbedemeji (IC50) ti iyipada ti o ni ibatan si tente oke ti iru egan ti ko ni iyipada (WT) ti o ni D614G ninu.Laini bulu buluu 1 ṣe aṣoju ipa didoju kan ti o jọra si WT, ati pe iye kan> 1 ṣe aṣoju atako didoju ti o pọ si.Awọ aami naa tọka boya o fẹ sa fun lati maapu naa.Awọn aami tọkasi wipe niwon IC50 ni ita awọn fomipo jara lo, awọn ọpọ ayipada ti wa ni ẹnikeji (oke tabi isalẹ opin).Pupọ julọ awọn mutanti ni idanwo ni ẹda-ẹda, nitorinaa awọn aaye meji wa.Ipilẹ didoju pipe ti han ni Figure 2. S3.Awọn kukuru lẹta kan ti awọn iṣẹku amino acid jẹ bi atẹle: A, Ala;C, Cysteine;D, Asp;E, Glu;F, Phé;G, Gly;H, tirẹ;I, Ile;K, lysine;L, Liu;Metropolis N, Assen;P, Pro;Q, Gln;R, Arg;S, Ser;T, Thr;V, Val;W, tryptophan;ati Y, Tir.
Ni ibere lati mọ daju awọn antigenic ipa ti awọn iyipada bọtini, a ṣe a yomi assay lilo panicle pseudotyped lentiviral patikulu, ati ki o ri pe o wa ni a aitasera laarin agboguntaisan abuda ona abayo maapu ati awọn yomi assay (Figure 1C ati Figure S3).Gẹgẹbi a ti ṣe yẹ lati REGN-COV2 maapu antibody, iyipada ni ipo 486 jẹ didoju nipasẹ REGN10933 nikan, lakoko ti iyipada ni awọn ipo 439 ati 444 jẹ didoju nipasẹ REGN10987, nitorinaa awọn iyipada wọnyi ko le sa fun.Ṣugbọn E406W sa fun awọn ọlọjẹ REGN-COV2 meji, nitorinaa o tun sa fun adalu naa ni agbara.Nipasẹ igbekale igbekale ati yiyan ona abayo ọlọjẹ, Regeneron gbagbọ pe ko si iyipada amino acid kan ti o le sa fun awọn ajẹsara meji ninu amulumala (11, 12), ṣugbọn maapu pipe wa ṣe idanimọ E406W bi iyipada abayọ amulumala.E406W ni ipa lori REGN-COV2 agboguntaisan ni ọna kan pato, ati pe ko ṣe dabaru ni pataki pẹlu iṣẹ RBD, nitori pe o dinku ipa didoju ti LY-CoV016 (Figure 1C) ati titer ti awọn patikulu lentiviral pseudotyped spiked (Eyaworan). S3F).
Lati le ṣawari boya maapu ona abayo wa ni ibamu pẹlu itankalẹ ti awọn ọlọjẹ labẹ yiyan antibody, a kọkọ ṣayẹwo data ti idanwo yiyan ona abayo ọlọjẹ Regeneron, ninu eyiti iwasoke ikosile ti dagba ni aṣa sẹẹli ni iwaju eyikeyi REGN10933 The vesicular kokoro stomatitis (VSV), REGN10987 tabi REGN-COV2 amulumala (12).Iṣẹ yii ṣe idanimọ awọn iyipada abayo marun lati REGN10933, awọn iyipada abayo meji lati REGN10987, ko si si awọn iyipada lati amulumala (Figure 2A).Awọn iyipada ti a yan nipasẹ gbogbo awọn aṣa sẹẹli meje ni a ṣe afihan ni maapu ona abayo wa, ati iyipada-nucleotide kan ti koodu iru egan ni ọna Wuhan-Hu-1 RBD tun wa ni iwọle (olusin 2B), ti o nfihan iyatọ laarin salọ Concordance aworan atọka ati itankalẹ ọlọjẹ labẹ titẹ antibody ni aṣa sẹẹli.O ṣe akiyesi pe E406W ko le wọle si nipasẹ awọn ayipada nucleotide ẹyọkan, eyiti o le ṣalaye idi ti yiyan amulumala Regeneron ko le ṣe idanimọ rẹ laibikita ifarada ti o dara ti kika RBD ati ibaramu ACE2.
(A) Ni iwaju awọn apo-ara, Regeneron nlo panicle pseudotype VSV lati yan awọn iyipada abayo ọlọjẹ ni aṣa sẹẹli (12).(B) Aworan ona abayo, bi o ṣe han ni Nọmba 1A, ṣugbọn fihan nikan awọn iyipada ti o wa nipasẹ iyipada nucleotide kan ni ọna Wuhan-Hu-1.Ti kii-grẹy tọkasi awọn iyipada ninu aṣa sẹẹli (pupa), ati awọn alaisan ti o ni arun (bulu)), tabi mejeeji (eleyi ti).Nọmba S5 fihan awọn aworan wọnyi, eyiti o jẹ awọ nipasẹ bii awọn iyipada ṣe ni ipa lori ibaramu ACE2 tabi ikosile RBD.(C) Kinetics ti iyipada RBD ni awọn alaisan ti a tọju pẹlu REGN-COV2 ni ọjọ 145th ti ikolu (laini inaro ti aami dudu).Awọn igbohunsafẹfẹ ti ọna asopọ laarin E484A ati F486I pọ si, ṣugbọn niwọn bi E484A kii ṣe iyipada ona abayo ninu eeya wa, ko han ni awọn panẹli miiran.Wo tun isiro.S4.(D) Awọn iyipada ona abayo ti o waye ni aṣa sẹẹli ati awọn alaisan ti o ni akoran wa ni iraye si nipasẹ nucleotide kan, ati isomọ ti awọn aporo abayo ko fa idiyele pataki eyikeyi si ibatan ACE2 [gẹgẹbi iwọn nipasẹ ọna ifihan iwukara (7)].Ojuami kọọkan jẹ iyipada, ati apẹrẹ ati awọ rẹ fihan boya o le wọle ati yan lakoko idagbasoke ọlọjẹ.Awọn aaye ọwọ ọtun diẹ sii lori ipo-x tọkasi abayọ abuda antibody ti o lagbara;awọn aaye ti o ga julọ lori y-axis tọkasi isunmọ ACE2 ti o ga julọ.
Lati le pinnu boya Escape Atlas le ṣe itupalẹ itankalẹ ti awọn ọlọjẹ ti n ṣe akoran eniyan, a ṣe ayẹwo data itọsẹ jinlẹ lati ọdọ alaisan ti o ni akoran ajẹsara ti o tẹsiwaju ti o gba REGN-COV2 ni ọjọ 145th lẹhin ayẹwo ti Itọju COVID-19 (16).Itọju pẹ ngbanilaaye olugbe gbogun ti alaisan lati ṣajọpọ oniruuru jiini, diẹ ninu eyiti o le ṣe nipasẹ aapọn ajẹsara, nitori alaisan naa ni idahun aiṣedeede autoneutralizing alailagbara ṣaaju itọju (16).Lẹhin iṣakoso ti REGN-COV2, igbohunsafẹfẹ ti awọn iyipada amino acid marun ni RBD yipada ni iyara (Nọmba 2C ati Nọmba S4).Maapu ona abayo wa fihan pe mẹta ninu awọn iyipada wọnyi salọ REGN10933 ati ọkan salọ REGN10987 (Figure 2B).O tọ lati ṣe akiyesi pe lẹhin itọju antibody, kii ṣe gbogbo awọn iyipada ni a gbe si aaye ti o wa titi.Ni ilodi si, igbega ati isubu ti idije wa (Figure 2C).Apẹrẹ yii ni a ti ṣe akiyesi ni itankalẹ inu ti awọn ogun adaṣe ti awọn ọlọjẹ miiran (17, 18), o ṣee ṣe nitori idije laarin gigun-ọfẹ jiini ati awọn ibatan gbogun ti.Mejeji ti awọn ipa wọnyi dabi ẹni pe wọn ṣe ipa ninu awọn alaisan ti o ni akoran ti o tẹsiwaju (Figure 2C ati Figure S4C): E484A (kii ṣe iyipada ona abayo ninu aworan atọka wa) ati F486I (asana REGN10933) gigun-ọfẹ lẹhin itọju, ati awọn laini ọlọjẹ ti o gbe N440D Ati Q493K (sa REGN10987 ati REGN10933, lẹsẹsẹ) akọkọ dije pẹlu REGN10933 sa mutant Y489H, ati lẹhinna ti njijadu pẹlu iran ti o gbe E484A ati F486I ati Q493K.
Mẹta ninu awọn iyipada ona abayo mẹrin ni awọn alaisan ti a tọju pẹlu REGN-COV2 ni a ko ṣe idanimọ ni yiyan aṣa sẹẹli ọlọjẹ Regeneron (Aṣayan 2B), eyiti o ṣapejuwe anfani ti maapu pipe.Yiyan ọlọjẹ ko pe nitori wọn le ṣe idanimọ eyikeyi awọn iyipada ti a yan laileto ni idanwo aṣa sẹẹli kan pato.Ni ilodi si, maapu pipe n ṣe alaye gbogbo awọn iyipada, eyiti o le pẹlu awọn iyipada ti o fa nipasẹ awọn idi ti ko ni ibatan si itọju, ṣugbọn lairotẹlẹ ni ipa lori abuda antibody.
Nitoribẹẹ, itankalẹ ti awọn ọlọjẹ ni ipa nipasẹ awọn idiwọn iṣẹ ṣiṣe ati titẹ lati yago fun awọn ọlọjẹ.Awọn iyipada ati awọn alaisan ti a yan ni aṣa sẹẹli nigbagbogbo pade awọn ibeere wọnyi: wọn sa fun isunmọ antibody, le wọle nipasẹ iyipada nucleotide kan, ati pe ko ni idiyele diẹ tabi ko si si isunmọ ACE2 [nipasẹ awọn iyipada jinlẹ ti iṣaaju ti o han nipa lilo wiwọn ọlọjẹ iwukara RBD (7) )] (Figure 2D ati Figure S5).Nitorinaa, maapu pipe ti bii awọn iyipada ṣe ni ipa lori awọn ami-ara biokemika bọtini ti RBD (bii ACE ati abuda antibody) le ṣee lo lati ṣe ayẹwo awọn ipa ọna ti o ṣeeṣe fun itankalẹ ọlọjẹ.Ikilọ kan ni pe ni aaye akoko itankalẹ to gun, bi a ti ṣe akiyesi ni ajesara gbogun ati ona abayo oogun, nitori awọn ibaraenisepo apọju, aaye ifarada fun awọn iyipada le yipada (19-21).
Maapu pipe naa gba wa laaye lati ṣe iṣiro awọn iyipada ona abayo ti o wa ninu SARS-CoV-2 kaakiri.A ṣayẹwo gbogbo awọn ilana SARS-CoV-2 ti eniyan ti o wa bi ti Oṣu Kini Ọjọ 11, Ọdun 2021 ati rii pe nọmba nla ti awọn iyipada RBD sa asala ọkan tabi diẹ sii awọn aporo-ara (Aworan 3).Sibẹsibẹ, iyipada ona abayo nikan ti o wa ni> 0.1% ti ọkọọkan jẹ REGN10933 ona abayo mutant Y453F [0.3% ti ọkọọkan;wo (12)], REGN10987 sa mutant N439K [1,7% ti ọkọọkan;wo Figure 1C ati (22)], Ati LY-CoV016 ona abayo iyipada K417N (0,1% ọkọọkan; wo tun Figure 1C).Y453F ni nkan ṣe pẹlu awọn ibesile ominira ti o ni ibatan si awọn oko mink ni Netherlands ati Denmark (23, 24);o tọ lati ṣe akiyesi pe ilana mink funrararẹ nigbakan ni awọn iyipada abayo miiran, bii F486L (24).N439K jẹ olokiki pupọ ni Yuroopu, ati pe o jẹ apakan nla ti ọkọọkan lati Ilu Scotland ati Ireland ni Yuroopu (22, 25).K417N wa ninu iran B.1.351 ti a kọkọ ṣe awari ni South Africa (10).Iyipada miiran ti ibakcdun lọwọlọwọ jẹ N501Y, eyiti o wa ni B.1.351 ati tun ni idile B.1.1.7 ti a damọ ni akọkọ ni UK (9).Maapu wa fihan pe N501Y ko ni ipa lori antibody REGN-COV2, ṣugbọn ipa iwọntunwọnsi nikan lori LY-CoV016 (Aworan 3).
Fun apakokoro kọọkan tabi apapọ agbo ogun, ni Oṣu Kini Ọjọ 11, Ọdun 2021, laarin awọn ilana 317,866 didara eniyan ti o ni agbara SARS-CoV-2 lori GISAID (26), ibatan laarin Dimegilio abayo fun iyipada kọọkan ati igbohunsafẹfẹ rẹ.O ti samisi.Iyipada amulumala REGN-COV2 E406W nilo ọpọlọpọ awọn iyipada nucleotide ni ọna Wuhan-Hu-1 RBD, ati pe ko ṣe akiyesi ni ọna GISAID.Awọn iyipada miiran ti E406 iyokù (E406Q ati E406D) ni a ṣe akiyesi pẹlu kika igbohunsafẹfẹ kekere, ṣugbọn awọn amino acids mutant wọnyi kii ṣe awọn iyipada nucleotide kan ti o jinna si W.
Gẹgẹbi a ti ṣe yẹ, awọn iyipada abayo nigbagbogbo waye ni wiwo antibody-RBD.Bibẹẹkọ, eto nikan ko to lati ṣe asọtẹlẹ iru awọn iyipada ti o ṣe laja ona abayo.Fun apẹẹrẹ, LY-CoV016 nlo awọn ẹwọn iwuwo ati ina lati dipọ si apọju jakejado ti o bori dada ACE2, ṣugbọn ilana ona abayo pẹlu awọn iyipada ninu awọn iṣẹku RBD ni agbegbe ti npinnu pq eru (Aworan 4A ati Nọmba S6, E si G).Ni ifiwera, sa asala lati REGN10933 ati REGN10987 ni pataki waye ni awọn iyoku RBD tolera ni wiwo ti eru antibody ati awọn ẹwọn ina (Nọmba 4A ati Nọmba S6, A si D).Iyipada E406W ti o salọ ninu idapọ REGN-COV2 waye ni awọn iṣẹku ti ko ni ibatan pẹlu boya egboogi-ara (Aworan 4, A ati B).Botilẹjẹpe E406 jẹ isunmọ isunmọ si LY-CoV016 (Figure 4B ati Figure S6H), iyipada E406W ni ipa ti o kere pupọ lori agboguntaisan (Ọya 1, B ati C), n tọka pe ẹrọ igbekalẹ gigun-gun kan pato jẹ egboogi-REGN - COV2 egboogi (olusin S6I).Ni akojọpọ, awọn iyipada ti o wa ni awọn iṣẹku RBD ni olubasọrọ pẹlu awọn apo-ara ko nigbagbogbo ṣe atunṣe abayo, ati diẹ ninu awọn iyipada abayọ pataki waye ni awọn iyokù ti kii ṣe olubasọrọ pẹlu awọn apo-ara (Nọmba 4B ati Figure S6, D ati G).
(A) Aworan ona abayo ti jẹ iṣẹ akanṣe lori ilana RBD ti a dè nipasẹ agboguntaisan.[REGN10933 ati REGN10987: Amuaradagba aaye data (PDB) ID 6XDG (11);LY-CoV016: PDB ID 7C01 (13)].Awọn ibugbe oniyipada ti awọn ẹwọn eru ati ina ti agboguntaisan ni a fihan bi awọn aworan efe buluu, ati awọ ti o wa lori oju RBD n tọka si agbara ti ipadasọna alalaja iyipada ni aaye yii (funfun tọkasi ko si ona abayo, ati pupa tọkasi alagbara julọ. ona abayo aaye ti egboogi tabi adalu).Awọn aaye ti kii ṣe iyipada iṣẹ-ṣiṣe ti wa ni grẹy jade.(B) Fun agboguntaisan kọọkan, ṣe iyasọtọ aaye naa bi olubasọrọ antibody taara (awọn ọta ti kii-hydrogen laarin 4Å ti agboguntaisan), antibody isunmọ (4 si 8Å) tabi antibody jijin (> 8Å).Ojuami kọọkan duro fun aaye kan, pin si ona abayo (pupa) tabi ti kii ṣe abayo (dudu).Laini daṣi grẹy duro fun iye to ṣe pataki ti a lo lati ṣe lẹtọ aaye naa bi ona abayo tabi aisi salọ (fun awọn alaye, wo Awọn ohun elo ati Awọn ọna).Awọn nọmba pupa ati dudu tọkasi iye awọn aaye ti o wa ninu ẹka kọọkan ti o salọ tabi ti a ko padanu.
Ninu iwadi yii, a ti ya aworan awọn iyipada patapata ti o yago fun awọn aporo-ara anti-SARS-CoV-2 pataki mẹta.Awọn maapu wọnyi tọkasi pe isọdi iṣaaju ti awọn iyipada ona abayo ko pe.Bẹni awọn iyipada amino acid ẹyọkan ti o le sa fun awọn ajẹsara meji ninu amulumala REGN-COV2 ni a ti ṣe idanimọ, tabi pe wọn ko ṣe idanimọ pupọ julọ awọn alaisan ikolu ti o tẹsiwaju pẹlu amulumala.iyipada.Nitoribẹẹ, maapu wa ko tii dahun ibeere titẹ pupọ julọ: Njẹ SARS-CoV-2 yoo ṣe idagbasoke resistance nla si awọn ọlọjẹ wọnyi?Ṣugbọn ohun ti o daju ni pe o jẹ aibalẹ pe ọpọlọpọ awọn iyipada abayo ni ipa diẹ lori kika RBD tabi isunmọ olugba, ati pe diẹ ninu awọn iyipada ipele kekere ti wa tẹlẹ ninu awọn ọlọjẹ kaakiri.Ni ipari, o jẹ dandan lati duro ati akiyesi kini awọn iyipada SARS-CoV-2 yoo tan kaakiri nigbati o tan kaakiri laarin olugbe.Iṣẹ wa yoo ṣe iranlọwọ “akiyesi” nipa ṣiṣe alaye lẹsẹkẹsẹ ni ipa ti awọn iyipada ti a pin nipasẹ iwo-kakiri genome gbogun ti.
Eyi jẹ nkan iraye si ṣiṣi ti a pin kaakiri labẹ awọn ofin ti Iwe-aṣẹ Ifọwọsi Creative Commons.Nkan naa ngbanilaaye lilo ailopin, pinpin, ati ẹda ni eyikeyi alabọde labẹ ipo pe iṣẹ atilẹba ti tọka si daradara.
Akiyesi: A nikan beere lọwọ rẹ lati pese adirẹsi imeeli rẹ ki eniyan ti o ṣeduro si oju-iwe naa mọ pe o fẹ ki wọn rii imeeli ati pe kii ṣe àwúrúju.A kii yoo gba awọn adirẹsi imeeli eyikeyi.
Ibeere yii ni a lo lati ṣe idanwo boya o jẹ alejo ati ṣe idiwọ ifakalẹ àwúrúju laifọwọyi.
Tyler N.Starr, Allison J.Greaney, Amin Addetia, William W. Hannon, Manish C. Choudhary (Manish C. Choudhary), Adam S. Dinges (Adam S.
Maapu pipe ti awọn iyipada SARS-CoV-2 ti o salọ fun adalu antibody Regeneron monoclonal ṣe iranlọwọ lati ṣalaye itankalẹ ti ọlọjẹ ni atọju awọn alaisan.
Tyler N.Starr, Allison J.Greaney, Amin Addetia, William W. Hannon, Manish C. Choudhary (Manish C. Choudhary), Adam S. Dinges (Adam S.
Maapu pipe ti awọn iyipada SARS-CoV-2 ti o salọ fun adalu antibody Regeneron monoclonal ṣe iranlọwọ lati ṣalaye itankalẹ ti ọlọjẹ ni atọju awọn alaisan.
©2021 Ẹgbẹ Amẹrika fun Ilọsiwaju ti Imọ.gbogbo awọn ẹtọ wa ni ipamọ.AAAS jẹ alabaṣepọ ti HINARI, AGORA, OARE, CHORUS, CLOCKSS, CrossRef ati COUNTER.Science ISSN 1095-9203.


Akoko ifiweranṣẹ: Oṣu Kẹta-24-2021